我們之前提到過,莫特魯斯曾經在米撒通過奧科特蘭山谷的時候,試圖加入安奎利塔斯的軍隊,但被拒絕。由于勢單力孤,他當時沒有對薩赫利人發動進攻,而是在看到珀琉斯軍隊敗走以後,回到了霍索恩。在前往霍索恩的路上,得知當時戰況的安奎利塔斯的公民們對莫特魯斯指指點點,充滿不敬之意。不過,雖然安奎利塔斯的公民對莫特魯斯心懷惡感,可莫特魯斯本人一直都期待着一個契機,能讓他爲國效力,收複安奎利塔斯人失去的領土。後來,當米撒在加爾布雷斯被刺重傷,一個名叫波呂克斯的愛國者發動起一場聲勢十分浩大的軍事起義。他和在其他各地的反抗者共同組成了一個名叫“反薩赫利同盟”的組織,一起協同對薩赫利人作戰。也就是這個波呂克斯,他十分仰慕莫特魯斯的功績和人格,因此他邀請莫特魯斯參加到自己的同盟之中。莫特魯斯十分感激波呂克斯的建議,他立刻就帶着自己的夥伴們前往波呂克斯麾下服役。在以後的戰役裏,由于莫特魯斯和他的夥伴們每次作戰都身先士卒,最爲勇猛,因此在“反薩赫利同盟”這個組織裏的人逐漸覺得自己國人曾經對莫特魯斯的非議是錯誤的了。久而久之,當安奎利塔斯的各地公民們聽說莫特魯斯在爲他們的自由奮力抗争,不惜犧牲以後,他們也轉變了自己曾經的看法,認爲莫特魯斯過去的一切不利傳聞,都是由于敵對黨的迫害才出現的。當波呂克斯看到莫特魯斯已經成功消弭了其餘人對他的偏見後,波呂克斯就自願讓渡出指揮權,表示他和他的同伴們都期待接受莫特魯斯的領導。
在法魯格上任以後,已經是整個“反薩赫利同盟”中舉足輕重一員的莫特魯斯機敏地覺察到法魯格一系列政策的不得人心,因此他到處拉攏尚處于獨立狀态下的安奎利塔斯地區共同反抗薩赫利人的進攻。安奎利塔斯地區内,一直以來處于薩赫利人威脅下的比雷埃夫城首先響應莫特魯斯的号召,他們打開城門,把莫特魯斯的軍隊接近城中。督察官們派出一支軍隊前去圍剿,但被莫特魯斯打敗。于是緊接着更多的地區表示要加入到“反薩赫利人同盟”之中,包括許多當時還在薩赫利人治下的地區。莫特魯斯認識到,一個松散的同盟組織不足以與薩赫利人對抗,因此他号召各個城市和地區派出自己的代表,在比雷埃夫城舉行一次共同的會議,以商讨安奎利塔斯的未來。安奎利塔斯城内也有一些有權勢或者有洞見的人也希望加入莫特魯斯的會議中,因爲他們擔心如果現在不參加共同的會議,未來安奎利塔斯重建後,他們城市,連帶着他們自己都不會享受到過去的待遇了。于是許多人聚集在安奎利塔斯城中密謀策劃,并且推舉出伊塔庫亞作爲他們的代表,前去參加在比雷埃夫舉行的會議。
薩赫利人雖然沒有完全限制特朗西特斯公民的自由行動,可他們在自己的統治邊界各處都安置了哨站,并且禁止沒有總督命令的人穿越。因此伊塔庫亞把自己的女兒裝進一個花轎,包裹的嚴嚴實實,他自己打扮成一個仆人,駕着馬車穿越邊境。在邊境駐防的士兵們盤查伊塔庫亞的時候,伊塔庫亞就說,他是奉自己主人的命令給圖爾基(督察官之一)送女人去的。由于當時類似的事情常有發生,士兵們也就輕易把伊塔庫亞放了過去。趕到比雷埃夫的伊塔庫亞馬上換上高貴的行裝,說他是以安奎利塔斯城代表的身份來參加莫特魯斯主持的會議。
莫特魯斯認識伊塔庫亞,并且出于對他代表城市的尊重,把他安排在自己的右手邊參加會議。在這次會議上,莫特魯斯首先提出重建一個統一的政權,他說隻有這樣,安奎利塔斯人才能集合一切的力量對抗薩赫利人,并且重新在聯軍的共同議事會中取得讨論權——當時的共同議事會欺侮安奎利塔斯人沒有統一與合法的政權,長久漠視安奎利塔斯代表的提議。他的這個提議得到了所有人的贊同,于是莫特魯斯接着說,他們或許可以直接模仿過去安奎利塔斯人的政治結構組成新的政府,大多數的代表對此也同意了。但波呂克斯這時站起來說,以往安奎利塔斯人的政府隻适合在和平或者情況并不緊急的情況下使用,而絕不适合一個正在爲博取自由與強敵戰争時的國家。他舉了曆史上許多故事,還有安奎利塔斯自己身上發生的故事爲例,說明一個民主的政府在最理想的狀态下,辦事效率仍然低下,更何況人們爲了自己的私利,經常還會出賣國家的利益。因此波呂克斯提議他們應該設置一個獨裁官,就像巴西爾建立他們剛剛想要模仿的政府時擁有的官職,波呂克斯說,這絕不是一種對自由的剝奪或者說倒退,而是爲了維護自由的權宜之計,在曆史上有許多民主政權都是通過設立短暫的獨裁官才渡過了亡國危機。波呂克斯的一番話讓與會大多數人改變了看法,他們又開始支持在過去的政府基礎上,暫時增設一個統領一切的獨裁官。不過來自布魯爾城的代表科塔強烈反對這個措施,他指着波呂克斯問莫特魯斯,波呂克斯說的話是不是莫特魯斯指示的。莫特魯斯和波呂克斯都站起來否認,其中波呂克斯十分激動地說,科塔又要把私人的恩怨牽扯到公共利益上面了。最終沒有人響應科塔的話,莫特魯斯與波呂克斯的提議被通過。接着,伊塔庫亞說既然大家同意獨裁官的設立,那麽在這次會議上就應該選出他們的獨裁官,以免國家再度出于無人領導的狀态。幾乎所有人都提議莫特魯斯擔任這個職務,隻有科塔提議他自己擔任,于是莫特魯斯以絕對多數當選爲安奎利塔斯的獨裁官,負責統領一切國家事務。
大部分記載都說,在這場會議之前,莫特魯斯和波呂克斯達成過秘密的約定,不過就算這是真的,他們的所作所爲也無可指摘,因爲那個時代持有共同立場的人,總是習慣爲避免失敗而采取聯合的行動。莫特魯斯在上任後,首先派出以科塔等十人組成的使團前往帕蒂略斯,取代過去一些年一直在那裏工作的安奎利塔斯代表們,以昭示安奎利塔斯已經重生。莫特魯斯任命科塔擔任這個職位,是因爲他看中科塔雄辯的口才,還有那堅韌不屈的性格,當然,也有可能是像某些人記述的那樣,他希望把科塔調到一個遠離自己的地方任職。之後,莫特魯斯開始改革軍制,他認識到,安奎利塔斯時常作戰失敗,并不完全是由于安奎利塔斯人的性格軟弱,而是士兵們在頻繁的變動中,既不熟悉自己的軍旗,又不熟悉自己的将官。當時安奎利塔斯的軍制是佩洛·麥齊納制定的,他看到在過去的年代裏,團結在一個軍團下,或者團結在一個将領下的士兵們是多麽嚣張跋扈,因此他解散了軍團的編制,每年變換安奎利塔斯的軍旗和将官,還有士兵們的駐守位置,以期割散士兵們的聯系,削弱士兵們的力量。佩洛的舉措确實成功了,在那以後的兩百年裏,安奎利塔斯再也沒有發生過不可遏制的士兵暴動,不過同時安奎利塔斯人的戰鬥力也被極大削弱。而莫特魯斯在權衡當時的各方面利弊後,決定恢複軍團建制。他規定每個軍團最多六千名士兵(當然,随着實際情況的變化,士兵數量還有兵種搭配都會跟随改變),還允許每個軍團保留一部分醫生和建築師等随軍人員。他一共建立了四個軍團,并親自給每個軍團賦以獨特的名稱與軍旗,分别是尤瑞斯、希帕索斯、梅若普、崔俄帕斯——曾經以這四個名稱命名的軍團,都在安奎利塔斯的曆史上立下過赫赫戰功。不過莫特魯斯改制時仍然有所保留,他不僅不允許任何一個軍團指揮官在自己的軍團上任期超過一年,而且不允許卸任的他們繼續留在相同的軍團内服役。