終于在經過漫長的行走之後，小霞、小智和小剛三人來到了大傻谷這個地方，這裏是以大溪谷景色而聞名全世界的地方，而且是小智夢寐以求的大傻谷。
“啊，這些人是幹什麽的，大傻谷到底發生什麽事情了”，看到好多人拿着鎬頭等東西一起向前走去，小霞非常的好奇。
“應該是挖化石吧，這個地方發現了已經絕種的神奇寶貝的化石，可能就是這個原因吧”，小智當然知道原因，所以解釋說。
“喲，我們的小智進步了，這種事都知道了”，這時後面突然傳來了小茂的聲音，“不行，再談下去，重要的化石會被别人挖走的，我現在很忙，沒時間陪你這個落伍的訓練家”，說完就跑了，弄得小智一頭霧水，‘好像一直都是你在說吧’，小智心裏小小的吐了下槽。
“我們也去看看吧”，小智建議說，然後三人繼續向前走去。
“哇，沒有想到來了這麽多的人耶”，走到大傻谷那裏後，就看到下面的山谷中到處都是人，他們都在忙着用鎬頭挖着化石，而小剛看到後很是驚訝，而後就聽到有個老學者說小茂挖到的是神奇寶貝的大便化石，弄得小智苦笑不得。
“嗯，不知道他們順不順利啊喵？”可是就在這時突然從旁邊傳來了喵喵的聲音，小霞、小智和小剛三人立刻就轉過頭去看到了喵喵站在一旁的山谷邊上。
“以他們過去的記錄，不知道可不可以依靠啊喵”，喵喵還在自言自語的說着，完全沒發現小智、小霞和小剛三人。
“…………（火箭隊經典台詞）”，這時武藏和小次郎突然從一塊岩石後面出來，就開始對着喵喵說開場台詞。
“我打，我打，将那些廢話，一點用都沒有，你們到底裝好炸彈了沒有啊喵”，不過喵喵實在是聽不下去了，打斷了武藏和小次郎并且問道。
“幹什麽啊你”，武藏被打後，就立刻發威了，把喵喵打飛了，撞到了旁邊的岩壁上，“炸彈，我們當然裝好了”，武藏随後又很有氣勢的說。
“就是啊，隻要炸掉這一帶的岩盤的話，隐藏的神奇寶貝化石一定就可以得到的”，小次郎也随後無所謂的說。
“炸彈？他們想用炸藥炸毀大傻谷耶”，小霞在一旁聽了火箭隊的對話後，既驚訝又氣憤。
“真的這樣的話，下面的人就有危險了”，小剛則是想到那些在下面山谷挖化石的人，非常的擔心。
“好，我們去阻止他們”，“皮丘~”，小智說完就向那邊跑去，小霞和小剛也隻好跟在後面。
“哈哈，這下子神奇寶貝的化石，全都是我們的了喵”，可是在小智、小霞和小剛趕到的時候，喵喵已經把導火線點燃了，而且已經燒的很遠了。
“我們追，去滅掉它”，小智看到導火線後，就立刻向前追去，小霞和小剛緊随其後。
“臭小鬼，不會讓你們得逞的，我們也去”，武藏看到小智他們要去滅導火線，所以拉着小次郎和喵喵也追了上來，就這樣導火線最終還是沒追上，而炸彈就在小智他們的眼前爆炸了，地面裂開了一個大縫子，“啊——”，小智等人和火箭隊開始下落。
“暴鯉龍，出來吧”，小霞在空中派出了暴鯉龍，雖然它除了飛跳之外不會其他的飛行系技能，但畢竟是飛行系神奇寶貝，所以暴鯉龍載着小智、小霞和小剛慢慢的安全着陸了。
“回來吧，暴鯉龍”，着陸後，小霞收回了暴鯉龍，“這裏是哪裏啊？”随後小霞看着黑漆漆的四周問道。
“這裏應該是大傻谷的地下洞窟，剛才的爆炸在上面開了一個大洞，我們是從那上面掉下來的喵”，喵喵這時猜測說。
“你說什麽？臭小鬼，都是你們害的”，武藏聽了喵喵的話很氣憤的對小智說道。
“對，就是因爲你們來妨礙我們，事情才會變成這個樣子的”，小次郎也随後生氣的對小智喊道。
“什麽？歸根究底，就是因爲你們不應該設置炸彈”，而小霞也不服輸的對着火箭隊喊道。
“火恐龍，就決定是你了”，小智這時派出了火恐龍，火恐龍一出來，就因爲尾巴的火焰而是四周明亮了起來。
“皮丘~”，就在大家想辦法的時候，皮丘突然指着一個地方叫了起來。
“啊~~，那…那個是什麽啊？”順着皮丘的手就看到那邊的黑暗中出現了好多的紅色光芒，在陰森森的洞窟裏顯得格外的吓人。
“是菊石獸、多次菊石獸、化石盔和鐮刀盔，據說是幾萬年前就絕種的神奇寶貝”，小智看到後解釋說，而且很高興。
“太棒了，我們将要成爲幸存的古代神奇寶貝發現者”，武藏和小次郎聽道小智的話後非常的高興，已經開始幻想以後美好的生活了。
“可是，它們好像不太友好，它們的眼中都充滿了血絲，難道是因爲我們才把他們吵醒的？”小霞這時發現問題後猜測說，而且有點怕怕的感覺，畢竟遠古的化石神奇寶貝的兇性還是存在。
“胖丁，就決定是你了，使用唱歌”，胖丁出場後，一聽是唱歌，非常的高興，立刻就使用了唱歌技能，然後神奇寶貝和火箭隊睡着了，而小智、小霞和小剛早就因爲小智收服了胖丁，知道以後免不了會聽，于是都随手準備了耳塞，“去吧，神奇寶貝球”，看到神奇寶貝都睡着了，小智丢出了兩個寶貝球，收服了一隻多次菊石獸和一隻鐮刀盔，并傳送了回去，“小霞和小剛你們要收服嗎？”收服完後，看到小霞和小剛正不可思議的看着自己，小智于是問他們說。
“那是當然，它們可是水系神奇寶貝啊，去吧，寶貝球”，小霞收服了一隻菊石獸。
“培養絕種的神奇寶貝能讓我知道的更多，好，你也去吧，寶貝球”，小剛收服了一隻化石盔，然後分别把鐵甲貝和小拳石傳說了回去。
“我們繼續往前走，看看有沒有路吧”，因爲上面已經封死了，看到小霞和小剛都收服并且整理好後，小智說，其實他是有目的的。
“也隻好這樣了”，小霞雖然對此無語，可是沒有其他辦法了。
“那是什麽？”不知不覺走到一塊岩石前，看到上面有一隻神奇寶貝，小剛不知道是什麽，所以問道。
“是化石翼龍，也是絕種的神奇寶貝，火恐龍，你去，火焰漩渦”，看到化石翼龍，小智很興奮，所以對火恐龍說，而由于化石翼龍還在睡着，所以火恐龍火焰漩渦命中了，可是中了一擊後，化石翼龍也醒了過來，開始和火恐龍決鬥，化石翼龍不斷地使用翅膀攻擊，由于化石翼龍會飛，所以火恐龍一直被動，“火恐龍，不要輸啊，使用噴射火焰”，小智看到火恐龍被壓了，所以給火恐龍打氣，看着朝着自己飛來的化石翼龍，火恐龍使用了噴射火焰，不過化石翼龍避了過去，火恐龍氣的直蹦腳。
“火恐龍？”就在這時火恐龍身體發出白光，小霞疑問的說。
“太好了，噴火龍，使用龍之怒”，小智看到火恐龍進化了噴火龍很高興，而且進化成噴火龍後也可以飛了，所以噴火龍的龍之怒命中了還在戲耍噴火龍的化石翼龍，化石翼龍被攻擊到後非常生氣，朝着噴火龍沖了過來，使用了突擊絕招。
“噴火龍，抓住它，使用地球上投”，在化石翼龍快攻到噴火龍的時候，小智下令說，然後就看到噴火龍雖然受到了化石翼龍的沖擊力，不過是成功的抓住了化石翼龍，并且使用了地球上投，格鬥系對岩石系效果拔群，化石翼龍栽倒在了地上，“去吧，神奇寶貝球”，小智丢出寶貝球，成功收複了化石翼龍，然後傳回了胖丁。
“小智，你又收複了耶，恭喜”，“皮丘~”，小霞和小剛看到在這麽驚心動魄的戰鬥後，小智收服了化石翼龍，高興的向小智道賀，皮丘也高興的叫着。
“謝謝，好了，我們繼續找路吧”，小智聽後也非常高興，不過現在事情都解決了，該出去了。
“好像沒有路唉”，在經過探索後，小智等人又回到了掉下來的位置，小霞非常的沮喪。
“既然這樣，小霞、小剛你們讓一下，化石翼龍，決定是你了，使用突擊朝着上方”，化石翼龍特性的石頭腦袋，突擊成功的撞開了擋住的石頭，然後小智等人就乘着化石翼龍回到了地面，而我們可愛的火箭隊隻好被遺忘了。
到了地面後，小智立刻把那顆在旁邊的蛋放入了包内，然後在用噴火龍交換了妙蛙種子後，小智等人又繼續踏上旅行了。
“小霞，給”，在離開大傻谷并繼續向前行進的路上，小智把波克比的蛋遞給了小霞。
“小智，這是？”小霞對此很是不解。
“我不是答應有好的神奇寶貝要送給你嗎？這是在大傻谷撿到的，我猜應該是波克比的蛋”，小智把蛋遞給小霞後繼續說。
“波克比？”小霞好奇的問，從來都沒有聽說過波克比呢。
“就是這隻”，小智邊說便把圖鑒翻到波克比那一頁給小霞看，“你看蛋殼，是不是一樣啊”。
“啊，好可愛，真的要送給我嗎？”小霞非常喜歡，但又怕小智是忍痛給自己的，所以不确定的問。
“嗯，送給你的”，小智笑着說。
“謝謝，太好了，對了小剛，教我怎麽讓它孵化”，抱着波克比的蛋小霞高興的向小剛請教去了，而他們的旅行也繼續着。
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