四谷基金的建立就是用來控制和操縱日本黑社會，是幹髒事的經費，敲詐、綁架和暗殺。 威洛比将軍和盟軍最高司令部的情報部門g-2的頭目控制着四谷基金，并且與兒玉的“雅庫紮”人馬合作，在美國占領期間一起鎮壓左翼運動或群衆示威活動。
基南基金是由一位叫約瑟夫.B.基南的文職人員控制的。他是東京戰争罪行審判的席檢察官，麥克阿瑟的另一位密友。m基金和四谷基金的任務範圍廣，而基南基金的任務則比較單一和特殊。
它是用來賄賂戰犯審判的證人或者賄賂中間調解人，讓他們勸說證人作僞證。在弗吉尼亞諾福克的麥克阿瑟紀念館找到的資料顯示：麥克阿瑟、邦納、費勒斯與前總統赫伯特、胡佛串通一氣，保證裕仁不受任何形式的懲罰；東條将軍将作僞證，承擔珍珠港事件的所有責任。
八國聯軍打劫的不過是中國皇家的部分财富，而對民間财富幾乎未動。但日本不一樣，從皇宮到民間，甚至各種存在于中國、控制大量财富的黑社會組織，幾乎全部被日本洗劫一空。因此，這筆财富之巨大，完全可以想象。
其他東南亞國家也一樣，比如朝鮮是日本的海外殖民地，日本作爲統治者，以各種合法的名義洗劫朝鮮财富。朝鮮出産的青瓷聞名于世，日本侵占朝鮮後，搶劫了朝鮮宮廷和民間收藏的青瓷後仍不滿足。
在寺内正毅擔任朝鮮總監期間，日本大肆挖掘朝鮮古墓多達2ooo多處，其中包括位于開城的朝鮮王陵，掠走廊墓中所有的珍寶，包括青瓷、佛像、王冠、項鏈、耳環、銅鏡和其它裝飾品。
日本還以科學研究爲名，把數以萬計的朝鮮文物古籍運到日本國内，這些都是朝鮮的國寶。朝鮮寺廟也未能幸免，精美的佛像和銅鍾被運到日本，一切金屬宗教法器都被搶走，用于鑄造武器。
滿鐵、三井和三菱等日本大企業以研究中國爲名，派出了大批情報人員，打着“學術”的幌子，對中國各地的資源進行了調查。
滿鐵在上海、南京、杭州、廣州、香港等地設立了分支機構，中國各地的工農業産品、政府和民間的财富被他們偵查得很清楚。這些所謂“學者”後來成爲了金百合計劃的執行者，随着日軍的鐵蹄前進。
關東軍動九一八事變的第二天就占領了沈陽銀行大樓、邊疆銀行和東三省銀行的金庫。占領東三省後，日本憲兵隊洗劫了所有的省行以及各地支行，将大筆黃金及貨币據爲己有。
日軍偷襲珍珠港後，用5個月的時間席卷東南亞，占領新加坡後，轶父宮在新加坡建立了金百合計劃的地區總部，不吉隆坡和槟榔嶼作爲搶劫贓物的中轉戰。
在吉隆坡馬來西亞中央銀行金庫，日本人搶到了許多金磚，每塊重6.25公斤。他們還從馬來西亞各省的馬來酋長和華僑手中搶到了大量金磚。
東南亞很多富裕的信徒用黃金鑄造成佛像，爲防盜竊，他們在佛像外面敷上石膏。日軍把大量佛像推倒砸開，被他們奪走的黃金佛像，單單在緬甸就有8噸之多。1942年7月，日本人搶到了一尊4.5米高的金佛。
當時菲律賓國庫中有51噸黃金、32噸銀塊、14o噸銀币和27oo萬美國财政公債，還有大量寶石和有價證券。這些财富除一部分銀币外，全部落入日本人之手。
日軍包圍了上層人士和中産階級住宅區，迫令其離開住宅。随後憲兵入室洗劫資産，一切值錢物件以及金屬制品被洗劫一空。他們還經常搜查平民，以獲得藏匿的黃金和寶石。
大量的日本銀行職員被派到東南亞各地，協助日軍清理當地銀行賬目，尋找出被隐藏的帳戶和财産。日本人用刑訊等手段迫使當地銀行工作人員交出秘密庫房和保險箱的鑰匙，拒絕合作者大都會被折磨至死，利用這種方法，日本人在爪哇銀行一次就得到52oo萬荷蘭盾現金。
日軍還通過大規模綁架勒索、強制勞工、建立賭場和妓院等罪惡的場所掠奪财富。除了**裸的搶劫外，日軍每占領一地，就行沒有任何信用和資本儲備的軍票，強制流通。通過這種方式，他們獲得了大量物資以及大量占領地的貨币。
占領東三省後，設立滿洲國中央銀行，行占領券作爲新貨币，強迫中國居民把有價值的中國貨币兌換來的中國貨币從中國套取戰争物資。日本人在東南亞如法炮制。不斷加大軍票行量造成通貨膨脹，軍票信用度不斷下降，當一種軍票喪失信用時，日本就用新的軍票代替舊軍票。
在華北，渡邊亘大佐采用威脅閹割有錢人長子的方法勒索了大量黃金、珠寶和藝術品。在新加坡，遷政信大佐用暴行開路，1942年2月21日開始，他下令對新加坡華人進行大屠殺，馬來半島共有4萬華人被屠殺。
接着他要求華人向天皇貢獻5ooo萬日元“贖罪費”處于驚恐中的新加坡華人無法在短期内籌集到如此數額巨大的款項，他就替華人向橫濱正金銀行貸款，用這筆巨大的财富，送給天皇作爲禮物，然後強迫華人交出大量金磚和外國硬通貨以及有形資産。
日本軍隊和黑社會還建立了慰安婦制度，從亞洲各國，主要是朝鮮和中國征婦女充當慰安婦。據估計被迫害婦女多達2o萬人。這些婦女用**換來的肮髒的錢也流入了日本軍國主義者手中，成爲金百合計劃的一部分。
中國的國寶，人類學曆史上最珍貴的北京猿人頭蓋骨和牙齒可能被日本侵略軍劫掠到了日本皇宮。
1941年11月，離太平洋戰争爆還有幾個星期，北京協和醫學院的工作人員擔心日本會把這個稀世珍寶搶走，打算将化石轉移到美國史密斯學會，等抗戰勝利後再運回來。他們将化石細心地包裝好之後，放在了9個鐵制的彈藥箱裏，這些箱子交給了美國海軍中尉福利。
福利當時享有外交豁免權，這些箱子可以當作他的私人财産帶走。但福利還未離開中國，珍珠港事件就爆了。爲保護化石，他随身攜帶箱子，四個半星期之後，一位日本軍官搶奪他的箱子。福利作爲戰俘勞工在三菱公司的礦井中工作了三年半，戰後他向朋友們講述了這件事情。
通過金百合計劃，日本在東南亞各國掠奪的财富都經馬尼拉運到東京。而股票、證券、持金證書等非物質财富被送到橫濱正金銀行和日本銀行，然後再轉移到日本人在中立國銀行開設的帳戶上。日本将掠奪的金澆鑄爲符合國際标準的金塊，再存入中立國銀行。
當時橫濱正金銀行最大持股人就是裕仁天皇，他擁有22％的股票。戰争結束時，裕仁已擁有資産1億美元，這相當于今天的1o億美元，這筆巨額資産以黃金和外國貨币的形式存在瑞士、南美、葡萄牙、西班牙和凡蒂岡的銀行裏。
在南京成爲廢墟時，中國珍貴藏書、文件等還被日軍嚴密保護。後來曾有1ooo多名日本專家來到南京，爲日本皇家圖書館優先挑選最珍貴的物品，天皇曾親自過目最珍貴物品的目錄。
選中的物品都被編号和打包，用3oo多輛卡車把這些箱子運往上海，然後裝船。這些書的一部分被用來建立位于東京的東亞研究所、東方文化研究所、東亞經濟研究所、東亞地方病研究所、大東亞圖書館等。
戰後美國經過調查後确認，日本至少有17處地方存放這些戰時搶來的書籍，其中有日本皇宮、皇室内宮、靖國神社、東京科學博物館、東京美術學院、早稻田大學、東京帝國大學和慶應大學。美國占領當局的結論是，日本有3oo萬冊從中國各地圖書館搶來的珍貴圖書和手稿。日本僅歸還了大約16萬冊，不足6％。