北路軍打垮了清軍江北大營，任務遠未結束。淮北一帶，還有另外一個棘手的敵人：撚軍。
若說是敵人，也并不恰當。因爲大部分的撚軍都是反清的，算是複興軍的天然盟友。但撚軍是民間傳統武裝，帶有根深蒂固的落後性，與複興會的綱領格格不入。複興會要想皖北、江北建立穩固的基層政權，必須除去撚軍。
北路軍攻破江北大營後，與并肩戰鬥的撚軍發生了一場嚴重的沖突。事情雖然平息了下來，卻傳到了吳捷耳朵裏，促使他下定決心：必須徹底收編撚軍，平複淮北。
當時，北路軍猛追江北大營敗兵。一部撚軍擅自違反軍令，前往清江浦劫掠。
清江浦是滿清南河總督駐地，位于今淮安市主城區，是京杭大運河畔的商業重鎮，有一條二十裏長的沿河街市。滿清朝廷在清江浦設有皇倉，專門儲存糧食，隸屬于戶部，還有四大造船廠，隸屬于工部。
複興軍在此駐有一個營的兵馬。兩千多個撚軍打算搶劫清江浦的街市，被複興軍阻攔。雙方擦槍走火，爆發了嚴重沖突。
事件導緻三十四名複興軍人陣亡，撚軍則擔心受罰，連夜逃往北方，背叛了複興軍。
吳捷聞知此事件後，憤怒不已。他早年做太平軍大将，還被撚軍圍困過。
撚軍一向唯利是圖，首鼠兩端，吳捷對他們素無好感。
但撚軍是一個複雜的群體，有張樂行、龔得樹這樣的行俠仗義之人，也有李昭壽、劉餓狼那樣的見利忘義之徒。
要對付撚軍，必須循序漸進，不能太過着急，防止他們狗急跳牆，倒向清軍陣營。
撚軍起源于“撚子”。“撚”是淮北方言，意思是“一股一夥”。撚子亦民亦匪，所謂“居者爲民，出者爲撚”，農忙爲民，農閑爲撚。
1851年，撚子在豫南聚衆鬧事。
1852年，皖北大旱，入撚農民增多。當年，撚衆在安徽亳州雉河集歃血爲盟，推張洛行爲盟主，起義抗清，号稱“十八鋪聚義”。
1855年，黃河決口，淮北一帶洪水滔天，農民流離失所，被迫入撚。淮河南北，遍地皆撚。當年秋，各路撚軍會盟，亳州、蒙城撚軍推張樂行爲盟主，正式組建撚軍，建立黃、白藍、黑、紅“五旗軍制”。
1856年，張樂行接受太平天國封号，但拒絕收編，“聽封不聽調”。
1857年初，黃旗主張樂行、白旗主恭得樹等人主張南渡淮河，配合複興軍作戰。其他各旗反對。張樂行一怒之下，襲殺了很多反對者。盡管如此，其他各旗主仍然帶着各自的撚軍返回淮北。
雷振邦是左七軍第三師師長，兼任安徽軍政委員會的主任。第三師不斷抽調兵力支援前線，雷振邦亦無力約束淮北一帶的撚軍。
在淮北，即便有些縣城已經被複興軍占據，大鄉村卻仍是撚軍的地盤。
雷振邦派出了很多軍隊、土改幹部支援兩湖，在淮北無力開展土改，也不便與撚軍激化矛盾。
很多撚軍在複興軍、清軍之間首鼠兩端，複興軍強時便投靠複興軍，清軍強時便投靠清軍。
譬如，撚軍出身的李昭壽，一度割據滁州。此人毫無底線，在太平軍、複興軍、清軍之間左右搖擺，臭名昭著。曾國藩曾一針見血地評價他“暴戾險詐，最難馴馭”。
除了撚軍，淮北還有大量的地主團練，以抵禦撚軍爲名，行割據地方之實。
最典型者莫過于苗霈霖。苗霈霖人稱“小周瑜”，以“築寨”、“積粟”、“治兵”爲方針，勢力迅速膨脹。他一度割據皖北，在太平軍、清軍、複興軍之間左右逢源，占據臨淮、颍上、壽州等濱淮地區。
不管是撚軍還是地主團練，他們都取得了當地基層政權，控制了當地社會。
隻要本地的農民加入當地的撚軍或者團練，就可以得到撚軍或者地主團練的保護，官府不能收稅，盜匪不能侵擾。他們還插手基層糾紛，代行官府之權，百姓爲之信服。
清軍占據皖北重鎮，派官差向當地農村收取賦稅。撚軍和地主團練就發起“抗糧殺差”，襲殺官府派來的糧差，使官府威信蕩然無存。
尤其是撚軍，已經嚴重危及複興會對淮北農村的控制。不除掉撚軍，複興會就不能在淮北建立穩固的基層政權。
曆史上，撚軍在長期抗清作戰中，形成一套獨特的流動戰法，常能克敵制勝。就連威名赫赫的僧格林沁，也死在了撚軍手下。
撚軍給清朝統治以沉重打擊，但也給北方的老百姓帶來了深重的災難。
僧格林沁死後，清廷派曾國藩平撚。曾國藩以平定太平天國之餘威，在剿撚問題上卻屢遭敗績。後來，左宗棠與李鴻章聯手，左宗棠平西撚，李鴻章平東撚，總算剿滅了撚軍。
這一次，北路軍北渡長江，除了要打清軍江北大營，還負有平複淮北的任務。
平複淮北的關鍵，在于正确對待撚軍（地主團練），分瓦解撚軍（地主團練），使複興軍在淮北順利建立基層政權。
按照吳捷的指示，北路軍将在第二師師長倪雲鵬率領下，彙合騎兵師周洋部、太平軍陳玉成部、太平軍秦日綱部，會攻徐州，與勝保的清軍、袁甲三的團練展開決戰。
北路軍不難攻下徐州，之後将留兵鎮守徐州，收編撚軍，平複淮北。
對于如何平複淮北，吳捷要求北路軍堅持以下原則：
一、堅決收編撚軍、地主團練、太平軍。
複興會的治下，隻能存在一支武裝力量，那就是複興軍。北路軍奪下淮北後，不管是撚軍還是地主團練，包括天地會、白蓮教等秘密會黨，要麽解散爲民，要麽接受收編，不允許單獨存在。
爲了保證複興軍的純正性，收編撚軍、地主團練必須是徹底的、不留任何餘地的。
皖北、江北還有數支太平軍，強者如陳玉成部、秦日綱部。這兩部太平軍也必須接受改編。
若有不從，則以敵軍處之。
在軍隊問題上，态度必須堅決，必須旗幟鮮明，具體實施起來，則要講究方式方法。
二、要區别對待。
撚軍派系林立，要區别對待。
張洛行、龔得樹都是講信義、知廉恥的好漢。兩人抗清意志堅決，沒有什麽門戶之見，贊同複興會的主張。自1856年起，兩人便大力支持複興軍，率軍渡過淮河，與複興軍并肩戰鬥。
張洛行、龔得樹是複興軍的好朋友，主動要求複興會派代表指導工作。對于他們這些人，複興軍要采取親近态度，極力籠絡。
苗霈霖、李昭壽都是些見利忘義之徒，企圖割據一方，做個土皇帝。他們對自己的地盤控制較嚴，頑冥不化，首鼠兩端，必須堅決打擊之。
除此之外，還有大量的中間分子。他們大多受到裹挾，隻想保住眼前的利益，沒有太大的野心。亦盡量争取之。
左七軍騎兵師師長周洋出身于撚子，榮膺安徽軍政委員委員。吳捷知人善任，派他到淮北收編撚軍，摧毀撚軍根基，恢複政府統治。
三、要循序漸進。
淮北變亂爲時已久，要想平複淮北，難以一蹴而就。因此，吳捷強調，态度要鮮明，步驟要秩序漸進，不能激起大變。
同時，還要下大力氣治理淮河，興修水利，減少水患，恢複農業生産。
四、武力支持土改。
晚清時，清廷先後調集曾國藩、左宗棠、李鴻章三個大員平複撚軍。他們使用過查圩、保甲連坐、河防等方法堅壁清野，孤立撚軍，給北方經濟社會帶來了極大的破壞。
複興軍平複淮北，關鍵在于赢得百姓支持。要想赢得百姓支持，關鍵在于土改。老百姓得到撚軍的保護，故擁護撚軍。要想争取民心，就得靠土改。
土改是解決晚清民間矛盾的金鑰匙，爲此，複興軍要以武力爲後盾，堅決推行土改。