雙龍市的雙龍道館最近又重新開張了，鬥子和鳴依想要去取得她們的最後一枚徽章。
而小智則隻是單純地想去拿下第十枚徽章，向合衆地區最強的道館訓練家夏卡讨教讨教。
路過一座寶可夢幼兒園之後，小智一行人再次回到了竹蘭在漣漪鎮的别墅裏。
因爲要從青海波市去到雙龍市，從漣漪鎮拐過去會比較近。
再次回到了熟悉的地方，美洛耶塔也安心地唱起了古老之歌。
與此同時，在漣漪鎮附近海域的一座海上基地那裏，一架印有一個巨大的紅色“R”字标記的豪華私人客機緩緩地降落在基地的停機坪上。
塞格博士正帶着幾百名火箭隊隊員在此整齊列隊，恭迎坂木的到來。
“坂木老大，塞格率基地全體成員恭迎您的到來。”
“嗯，從今天開始，合衆地區将納入我們火箭隊的管轄，
暴風雨計劃，正式進入最後階段！”
坂木望着遠處的大海，充滿野心地說道。
“遵命。”
隔天一早，漣漪鎮。
一隻泥偶巨人從空中飛行而來，降落在别墅的院子裏。
一個男人從泥偶巨人身上跳了下來，叮囑道，
“泥偶巨人，捕捉到旋律了，空氣在顫動，這種感覺一定是美洛耶塔不會錯。”
聽到有人到别墅裏來，小智起身去看看，發現有個不認識的男人正在别墅的院子裏，似乎在找什麽東西，還帶了一隻泥偶巨人來。
而美洛耶塔一見到那個男人，便激動地飛過去，撲進他的懷裏。
“美洛！”
“美洛耶塔，你沒事真是太好了。”那男人也驚喜道。
小智随即把他迎進客廳裏。
那人把泥偶巨人留在院子裏負責警戒之後便跟小智進屋。
“真是非常感謝你們幫我保護美洛耶塔，
我叫拉裏，正在跟我的泥偶巨人一起尋找美洛耶塔，
你叫做小智是吧，美洛耶塔它現在好像已經跟你很親近了呢。”
“是啊，對了，拉裏先生，到底發生什麽事了？爲什麽美洛耶塔會跟你分開，被火箭隊的人追捕呢？”
“哦，是這樣的，我們和美洛耶塔，本來是一起隐居在合衆地區的某座森林的深處，
可是某一天，我們隐居的地方被人發現了，在我沒有注意到的時候，美洛耶塔就被那些壞人們給抓走了，
那群壞人，一定是在觊觎美洛耶塔所擁有的力量，這件事是我的重大失誤，所以我才會一直到處尋找美洛耶塔的蹤影。”
據拉裏所說，當時靠着火箭隊的人寶可夢的招式黑霧的掩護，抓走了美洛耶塔。
用的籠子小智猜測也是之前火箭隊用來抓三雲神的那同款抓捕神獸專用籠子，因爲拉裏說他的寶可夢的技能根本無法破壞那個籠子。
拉裏對此很是自責，因爲美洛耶塔出事的時候，他剛好有事離開了，沒有在美洛耶塔的身邊。
等到他收到消息趕過去的時候，美洛耶塔已經被火箭隊的人關進籠子裏運上直升機了。
拉裏拼命想要把美洛耶塔救出來，但是根本無法破壞那個籠子，靠着黑霧的掩護，火箭隊的直升機很快便揚長而去。
“可惡的火箭隊，我是不會讓他們得逞的。”小智道。
“沒想到竟然有這種事，火箭隊他們抓捕美洛耶塔，到底有什麽目的？”鬥子問道。
“火箭隊他們的目的并不是美洛耶塔，而是回應神殿散發出的光芒而出現的傳說中的寶可夢們，
擁有美洛耶塔的人，就可以掌控巨大的力量，從遙遠的太古時代開始，人們就爲了得到那股力量，而不斷地争戰搶奪美洛耶塔，那力量指的就是沉睡在神殿中的現形鏡，
美洛耶塔，是這個世界上唯一能夠解開現形鏡封印的寶可夢，通過現形鏡，可以掌控操縱大自然的力量，
能做到這件事的，隻有世世代代和美洛耶塔一同生活的守護者們的領袖而已，
可是，爲了得到那股力量，那些邪惡的人們不斷地争奪并掀起戰火，
美洛耶塔發現自己的存在會引起征戰，就把神殿沉入水底，然後和我們守護者們的祖先一起，将自己的行蹤隐藏起來，
如果有人想要得到現形鏡的話，就必須要有美洛耶塔的歌聲。”拉裏道。
“那美洛耶塔是拉裏先生你的寶可夢嗎？”鳴依問道。
“不，美洛耶塔并不屬于任何人，它是以合衆地區的幻之寶可夢的身份存留在人們的傳說當中的，
我們則是自古以來就被稱爲守護者，就是指守護美洛耶塔的人，
我們守護者擁有感知美洛耶塔的力量的能力，所以我才能找到這個地方來，
隻是現在還不能放心，那些壞人，應該也還在尋找美洛耶塔。”拉裏道。
“那要是敵人現在已經來了呢。”小智淡淡道。
“你說什麽！”
拉裏的話音剛落，小智便沒有說話，直接擡手凝聚出一發波導彈。
擊碎了客廳沙發後面的一面窗戶玻璃的同時，還擊毀了一架飛着的微型無人攝像機。
“啊，那是！果然來了，這裏也被他們發現了，美洛耶塔，我們快走，不能再拖拖拉拉的了。”
說完，拉裏急切地抱起美洛耶塔就要離開。
“等等，你們現在又能去哪裏，你們之前隐居的地方已經被火箭隊的人發現了，
而我猜測此刻，這座别墅大概率也已經被火箭隊的人給包圍住了。”小智道。
“隐居的地方倒是無所謂，我的同伴們已經在找新的地方了，可是你說他們已經包圍了這裏！”
“沒錯，我有波導之力。”
“火箭隊的人也太大膽了吧，這裏可是神奧地區的地區冠軍竹蘭小姐的别墅啊，難道他們不怕嗎？”鳴依道。
“冠軍！”
聽到這話，拉裏的眼睛亮了，仿佛找到了救命稻草。
“可是竹蘭小姐幾天前就出去了，去出席活動去了，到現在還沒有回來啊。”鬥子道。
聞言，拉裏頓時如同被澆了一桶冷水一樣，希望全滅。