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第二十五章人類基因組計劃一



中國北方的陽春三月并不象南方的春天那樣溫暖宜人,料峭的春寒有時會叫人忘記春天已經來臨,雖然已經是三月底了,但是大多數生活在c市的人們并沒有脫去厚厚的冬裝,人們還在依就寒冷的春風中祈禱着姗姗來遲的溫暖早日來臨。

一九九三年三月三十一日的上午,在我們天元集團的頂層辦公室裏,我還有李老師以及天元研究中心的各位項目負責人卻一點也感受不到外面的寒意,這并不是因爲屋子裏的暖氣溫度依然很足,而是因爲大家都被讨論的話題搞的熱血沸騰的。

我們在讨論什麽話題?我們在讨論人類基因組計劃。

首先發言的是研究中心基因研究室的負責人,叫陳東,他就是我們美國之行招回來的專家,他帶着一付淺色眼鏡,白淨淨的長相,一副書生模樣,但說起話來卻十分直接有力:“各位,我在這裏要提出一個建議,就是我們是否參加人類基因組計劃,如果參加的話,我們該如何參加,在這之前我想我有必要介紹一下人類基因組計劃的詳細情況。”

說到這裏他看了看我們四周的人,然後又接着開始說道:“對于人類而言,一直有一個夢想就是能夠解開自身的生命之迷,但是人類雖然已經經過多年的努力,但解開生命之謎的願望還未實現。而以往的一系列的失敗使大家認識到,單靠一門學科的獨自努力太局限了,難以完成人類對自身的認識和保護。美國投巨資的腫瘤十年計劃基本上以失敗告終就說明這個問題。現在,人們認識到先認識全局再研究局部也許會訊捷和方便的多。于是,人們回過頭來決定開始進行人的所有基因組的研究,由此形成了基因組學和人類基因組計劃(humangenomeprojecthgp)。這應該算是人類基因組計劃的來由了吧。

但是人類基因組計劃的具體發起卻是這樣的,1985年5月,美國能源部提出‘人類基因組計劃‘草案;經過一番讨論後于1986年3月宣布實施這個草案;1986年3月7日,dulbeccor在science上發表了一篇有關開展人類基因組計劃的短文,引起了全世界的強烈反響,不僅推動了美國,也推動了全世界的人類基因組計劃的發展;1987年初,美國能源部和國家健康研究院爲‘人類基因組計劃‘下撥了啓動經費550萬美元,全年1.66億美元;1988年2月,國家科學研究委員會的專家成立了‘國家人類基因組研究中心‘,由沃森任第一任主任;盡管有了以上這些工神作書吧,美國國會正式批準的‘人類基因組計劃‘到1990年10月1日才正式啓動,其規模在世界上是最大的,計劃在15年内投入30億美元以上的資金進行人類基因組的分析。

在dulbecco短文的影響下,整個歐洲也都行動起來了,并各具特色。1987年,意大利;1989年,英國;1990年,法國;1995年,德國,開始啓動各自的基因組計劃;1990年6月,歐共體通過‘歐洲人類基因組計劃‘。此外,丹麥,日本,韓國,俄羅斯和澳大利亞也加入行動行列。”

說到這裏陳東似乎有點累了,他停下來喝了一口水,然後又開始說道:“上面我初步介紹了人類基因組計劃的起源和目前的進展狀況,下面我再着重從技術層面講述一下人類基因組工程計劃的具體研究方向和目的。

hgp的基本任務可用4張圖譜來概括,即遺傳圖譜,物理圖譜,序列圖譜和基因圖譜。第一張圖是遺傳圖譜,它主要有三種層次,第一代标記是經典的遺傳标記,最初主要是利用蛋白質和免疫學的标記,如abo血型位點标記、hla位點标記。第二代标記稱‘小衛星中心‘和‘微衛星标記‘,它們分别是1985年和1989年發現的。‘微衛星标記‘又稱‘簡短串聯重複‘,最重要的優點是高度多态性,提供的信息量相對很大;第三代标記是稱神作書吧單核苷酸多态性标記的遺傳标記系統。

第二張圖主要是指物理圖譜,而完整的物理圖應包括人類基因組的不同載體dna克隆片段重疊群圖,大片段限制性内切酶切點圖,dna片段(探針)或一段特異dna序列(sts)的路标圖,以及基因組中廣泛存在的特征性序列等的标記圖,人類基因組的細胞遺傳學圖,最終在分子水平上與序列圖的統一。

第三張圖叫序列圖譜,因爲人類基因組計劃最初的目标是要在15年内完成測定總長度由30億個核苷酸組成的人類基因組的序列圖。按照測一個核苷酸一美元計算,計劃投入30億美元。這是一個明确、艱巨的定時、定量、定質的硬任務。遺傳圖和物理圖的構建都是爲繪制序列圖所制的。因爲目前的測序技術還不允許進行很長的dna測序,否則就不需要前兩張圖了。目前的策略是把龐大的基因組分成若幹有路标的區域後,進行測序分析。序列分析需要用一個區域的dna片段重疊群使測序工神作書吧不斷延伸,這中間的sts被用神作書吧任何兩個片段(上百個bp)間的重疊區域,使分别被測的短序列進行正确的拼接。基本策略是建立dna小片段的重疊群并盡可能地降低重疊部分所占的比例以提高效率和降低成本。

而最後一張圖也是最重要的是基因圖譜,而做謂的基因圖譜就是在人類基因組中鑒别出占據2-5%長度的全部基因的位置、結構與功能。涉及辦法很多,但最主要的是通過基因的表達産物mrna反追到染色體的位置,其原理是:所有生物性狀和疾病都是由結構或功能蛋白質決定的,而已知的所有蛋白質都是由rna聚合酶指導合成的帶有多聚a尾巴的mrna編碼的,這樣就可以把mrna通過反轉錄酶合成cdna或稱神作書吧est的部分cdna片段,然後,再用這種較穩定的cdna或est神作書吧爲‘探針‘進行分子雜交,鑒别出與轉錄有關的基因。此外,根據mrna的特點,可用與多聚a尾巴互補的寡聚t或克隆載體的相關序列爲引物,對mrna的雙端尾側的幾百個bp進行測序,得到est(表達序列标簽)。

基因圖譜的意義在于它能有效的反映在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖我們可以了解某一基因在不同時間不同組織不同水平的表達。有了‘正常‘的基因圖譜,就奠定了構建特定生理條件下(如受外源的病原體、藥物、食物、精神的刺激)與‘異常‘病理情況下,cdna差異圖的基礎,以此将爲21世紀的基因醫學繪制出指導的藍圖。”

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