麥小六在找到餘姚謝家這條線索後，立刻調動了中華公司在浙江的所有眼線，順藤摸瓜追查下去，謝家與尹峰的中華公司做對頭，已經好幾次了，上一次還在杭州設下埋伏向誘捕公司股東，因此，公司商情部在謝家周圍布下了不少暗樁眼線，隻是謝家久居餘姚，從東晉時代算起已經一千三百多年了，家族勢力盤根錯節遍布浙東，加上家族中出了幾任京官，官紳商結合，把持地方官府，橫行鄉裏，實在是地道的地頭蛇，因此中華公司很難在謝氏家族内部潛伏下眼線，隻是自謝家外圍的商鋪之類的地方潛伏了細作，所以并未發現謝家對此次朝廷新軍編練施加的小動作。
麥小六想着以謝家一個家族之力，是不可能有這個實力去澳門買大炮，編練一支火器化新軍所要動用的财力不是一家富商所能承受的，當年尹峰操練護衛隊，初期不過千把人，卻也要集合馬尼拉逃亡出來的幾百家商人的力量，加上自己和曾家幾乎傾家蕩産的付出，外加打劫了幾次日本朱印船得到的幾百萬兩銀子，才能建立起來一支火器部隊。
因此麥小六斷定，此事必定除餘姚謝氏家族以外，還有其他的官紳富商加入。
他動用了浙商之中屬于公司秘密股東，同時與謝家關系良好的那些商家人脈，在整個江南追查這條線索，這些年中華公司創辦的錢莊、銀号的生意模式已經遍布江南，很多商家的大筆資金流通都是通過錢莊銀号來辦理，雖然中華公司直屬的錢莊被查封了，但是在那些與公司聯盟合夥的浙商開辦的錢莊中，到處都有中華公司的諜報人員潛伏。
很快，通過一家蘇州富商的錢莊，麥小六查到了謝家的大筆資金流轉，以及和謝家同樣流向的資金來源：兩淮鹽商及以山西喬家爲首的晉商，最後，甚至發現了部分浙商的資金，麥小六再通過南直隸的商情部細作，打探出這些資金經過一番流轉後，最後都在謝家位于金陵城北的商号兌成白花花的白銀，進入了應天府的府庫，名義上是江南士紳的捐納，劃歸南京兵部專用。
麥小六一路追到南京，在南京花了筆錢賄賂了南京兵部的一名管庫文吏，從他手中得到了府庫交接的清單。
最終提取這一筆銀子運往浙江的，是署理新軍練兵事務的南京經略熊廷弼，具體經辦人是戶科給事中姚宗文，押送銀子的是直屬南京經略熊廷弼指揮的南京守備标營官兵。
麥小六到達南京時，距離他離開鎮江已經一個月後了，同樣在追查此案的林曉，卻由于一到南京就遇到了官紳士子圍攻中華公司商館一事，被一群士紳弄得焦頭爛額，因此，他忙于調動人手将商館撤離南京，還來不及去查辦此事。
麥小六來到南京時，那些整日鼓噪不休的士子甚至還在南京經略熊廷弼的府邸前示威，要求他出兵收複鎮江、蘇松等地，趕走海寇，這群士紳是從江南中華軍控制區逃出來的，圍攻中華公司-華興聯号商館就是爲了報複挑釁。
明朝初年，江南士紳由于對朱元璋采取不合作态度，曾被朱元璋狠狠教訓了一頓，老實了好多年，而如今的江南士子，奔競請托、行爲張揚、隐漏錢糧、好持公論、包攬詞訟，出入公門，勾結胥吏，幹預行政，武斷鄉裏，操持輿論，是他們的基本社會形象，紳士更是結社成幫，黨同伐異；幹預行政，把持鄉裏；侵奪小民産業，橫行不法；肆意奴役鄉民；接受投獻，蓄奴成風；奢侈淫佚，醉生夢死，有鑒于生員的惡習劣行，另一時空中的大儒顧炎武甚至将生員與鄉官和吏胥，比作“天下之病民”的三種人，主張：“廢天下之生員而官府之政清，廢天下之生員而百姓之困蘇，廢天下之生員而門戶之習除，廢天下之生員而用世之材出，”
象董其昌那樣表面上道貌岸然，實際上卻是鄉土一霸，縱容惡仆爲非作歹，結果惹起了士子、百姓群起而攻擊，則有所謂“民抄董其昌”之變，江南各地也多奴變，大明仕宦本來就享有蓄奴特權，而江南士紳更濫用這種特權，遠超法律規定大肆蓄養奴仆，“……吳中士宦之家，有至一二千人者，”徐階、董份、董其昌家，投靠家奴皆達上千，所投靠者，表面上出于自願，多半卻是因爲缙紳大戶獨多，享受優免特權，繁重的賦役負擔全部落在小民頭上，小民出于無奈而不得不投靠勢家以求庇護，如董其昌就是“膏腴萬頃，輸稅不過三分，遊船百艘，投靠居其大半”，董其昌宅第被鄉民焚毀，家财被掠。
（另一時空的明清鼎革之際太倉、上海、嘉定、昆山、石門、金壇、溧陽廣及蘇松常嘉四府之地紛紛發生奴變，索契殺主，實在是缙紳地主長期作威作福的結果，咎由自取，明末江南奴變最爲激烈，與當地豪門最爲集中、蓄奴風氣最盛、馭下最爲苛酷是有着必然聯系的，）
而中華公司由于在自己統治區急于需要各種勞動力，而且也有着大量倭人、西班牙、荷蘭戰俘以及土著人可以随意役使，因此極少有蓄奴的富商大賈，尹峰對于利用奴隸勞動沒有興趣，不過鑒于現實因素，他也不反對大量利用被打敗的土著以及各國戰俘做苦力，而江南家族中的那些奴仆，中華公司都是當做潛在移民對象看待的，況且農民可以三年免征賦稅的政策擺在面前，那些小民無需承擔繁重的賦役，也就無需投靠那些官紳士子了，由此，不少奴仆造反事件在中華軍統治區發生，而中華軍對此采取的态度是不聞不問，出了人命則将主家抄家，有命案在身的奴仆抓起來送往海外殖民地，服苦役若幹年；其餘的奴仆則就鼓勵他們離開主人家，去台灣、琉球、呂宋、婆羅洲、爪哇、蘇門答臘等等地方，那邊有大塊的土地等着他們去耕種，除了給公司交租，别無勞役，因此，大批奴仆、佃戶、流民都投奔了中華軍。
中華軍進入江南的初期，士紳們被他們的武力鎮住了，後來發現這幫海寇想着要招安，也并不亂殺人，也就壯着膽子爲着自己的利益和地方利益向中華軍發難，不過，中華軍并非在地方上行政必須靠地方士紳的明朝官府，他們是講究以法治民的，士紳們的特權一樣也沒有，官紳民一體納稅是公司的基本政策，做買賣必須和小商販一樣納稅，出了命案就必須以法懲辦，沒有什麽人情可講，鬧事太出格的士紳，統統被中華軍抄家滅族，震懾得各家官紳士子閉門不出，而且，即使官紳們罷市、歇業，抵制鎮守府的行政措施，都會有中華軍黑衣士兵上門來以武力解決問題：中華軍和鎮守府不需要士紳們的财力和實力，就能在地方上推行自己的施政措施，官紳們如果武力反抗，那也是毫無用處的，中華軍的武力加上發動中下層民衆的能力，輕易就能将官紳們的反抗淹沒在血泊中。
陳衷紀來到江南鎮守府後，同樣以強力手段推行不擾民但是不姑息犯罪的政策，也拿出了一點胡羅蔔來籠絡江南士紳：服從中華軍統治者，可以進入鎮守府議事局，可以在公開的議事局會議上發揮士紳們的口才和文采，可以對任何事發表意見，可以推舉審計員核查鎮守府官員，而且，所有議事局委員都可以指責官員，但是必須有證據，無證據的指控鎮守府方面一律不予理會。
江南士紳盤根錯節、互相勾結的勢力，在以政府暴力爲基礎的有效行政機構面前，完全是毫無意義的存在。
因此，這些士紳不敢在中華軍統治區鬧事，卻逃到大明朝統治的南京來鬧事了。
而且，麥小六通過浙江之行，查出了一堆蘇州、松江、鎮江等地官紳富商的名單：這些人都出錢捐納了軍饷，給朝廷練新軍之用。
麥小六看到南京的亂象，也看到了林曉正在組織公司人員撤離南京，他認爲自己的任務并不包括幫助林曉辦理瑣事，率先離開了南京回了鎮江，林曉在三天後才在鎮江聽取了麥小六的調查報告，在場的還有陳衷紀，他在三天前就知道了麥小六的調查結果。
林曉非常嫉妒地聽了麥小六的報告，臉上卻是沒有什麽表示，冷冷地說：“如此看來，新軍的軍饷是江南各家官商士紳以及鹽商、晉商們籌集起來的,主要出資者是江南的官商大賈，發起者是餘姚謝家，江南官紳這麽做倒是可以理解，這徽商、晉商可是和我公司有着緊密生意往來的，可惡，這是明顯的腳踏兩隻船嗎，”
麥小六點點頭：“這些家官商大賈聯合起來，其勢力不可小看，我打聽到他們第一筆軍饷就籌到了一百萬兩之多，我已經動用商情部的信鴿，給船主大王送去了調查報告，詳細的報告也在昨天用海風号送往台灣港了，”
林曉臉色一黑，低下頭沉默不語，心中對麥小六随意動用自己管轄的商情部信鴿十分不滿，礙于陳衷紀在場，竭力把怒火壓抑下去，他咳嗽幾下，低着頭不看麥小六：“呵呵，大王有過命令，隻需查出新軍經費來源即可，并無進一步行動的指示，我們現在該如何辦，”
陳衷紀作爲江南鎮守府總管，兼管軍政民政，考慮得比較全面，他緩緩地說：“此事不可操之過急，我想靖海王殿下不太會立刻對新軍下手，首先得解決的是晉商、徽商中那些違反秘密股東協議的人，”