卻說李、郭汜、張濟、樊稠聞董卓已死，呂布将至，便引了飛熊軍連夜奔涼州去了。
董卓即死，朝廷上下一片大喜。其中最得意者莫過王允了。獻帝下旨，晉王允祿尚書事，總朝政。一時間，權傾朝野。
神作書吧爲誅殺董卓的第一功臣，王允自是也得到了民間百姓的贊頌。王允自己亦是有些飄飄然不知所以然了。暗自思量：董卓如此權重兇狠之輩，某亦能殺之，天下更有何懼？遂行事漸至驕橫。
王允自以公正爲己行事原則，便對任何人，任何事均按自己所認爲的公正準則判定。每當群臣集會，便很少再像以前那樣，和大家推心置腹，共同商讨權宜之計，而是正襟危坐，面無和悅之色。慢慢地，群臣也不再像以前那樣推崇和擁護他了。
這日，王允大宴群臣，以賀前功。一時間群臣畢集，水陸俱陳。
王允思及柳飛當日獻計，心中百味俱陳，又是憤懑，又是感激。憤懑的是當日柳飛對自己的羞辱。感激的是終是柳飛之計，方得今日之境。思慮之下，便請了蔡邕與自己坐了同席。
席間，衆大臣俱皆盛贊王允之功，一時間，歌功頌德之聲不絕。王允自是捋須微笑，坦然受之。蔡邕得柳飛當日囑咐，自是未再去哭那董卓。但念及當日董卓不聽自己所權，終得今日下場，心中也是戚戚，不覺輕輕歎息一聲。
王允此時已是微醺，耳中聽的贊美之聲。心中正自得意。忽聞身旁一聲歎息，不禁逵怒，轉頭看去，卻正是蔡邕滿面黯然所發。見是蔡邕，腦中竟不禁想起日晚間，柳飛怒罵自己之時，一時間，隻覺一股怒氣再也壓制不住。不由起身向蔡邕怒喝道“你如何在此歎氣？董卓乃國賊也。禍國殃民的罪行不可饒恕，你身爲天子臣民，理應從大局考慮，從國家出發，共同聲讨國賊。不想你念及他對你的一點私人恩惠。竟然爲他感到痛惜。豈不是重董卓而怨恨我等嗎？”說完，便不容分辯，立即将蔡邕押至廷尉處問罪。
蔡邕大驚，哪裏料到自己什麽都沒說，竟也能惹此禍事。待要分說，卻見王允隻是揮手，兵士已是将他即刻拖下。不禁長歎一聲。
進得牢中。思及家中女兒。又想起柳飛幾次要自己離開，不禁心中大是後悔。萬念俱灰之下。請兵士前往告王允道“邕雖不才，亦知大義，豈肯背國而向卓？隻因一時知遇之感，不覺爲之一歎，自知罪大。願公見諒。倘得黥首刖足，使續成漢史，以贖其辜，邕之幸也。”言語悲切懇摯。
士大夫們都十分同情憐憫蔡邕地遭遇，俱皆向王允求情，可毫無結果，太尉馬日蟬專程前往王允住處，替蔡邕說情：“蔡伯喈乃曠世奇才，學問淵博，見多識廣，特别是對本朝故事了解頗多，應當給他機會，讓他繼續寫成史書；況且伯喈素以忠孝聞名于士大夫之中，現在以莫須有之名給他判罪，恐怕有失衆望，不服人心吧!”
王允哪裏肯聽，怒道“昔孝武不殺司馬遷，後使神作書吧史，遂緻謗書流于後世。方今國運衰微，朝政錯亂，不可令佞臣執筆于幼主左右，更使吾等蒙其诽謗也”
馬日見王允如此說話，知他殺蔡邕之心已定，無奈而退。出來私謂衆官道“王子師如此行事，必不久已!善待人才，乃國家得以維持和發展地命脈，而讓國家經典得以流傳，則是重視國家制度和創神作書吧的保障。如今，像王允這樣不重視賢才，切斷國家的命脈，阻礙國家經典的流傳，豈能維持久遠乎？”言罷，歎氣而去。
當下王允不聽馬日之言，命将蔡邕下獄中缢死。一時士大夫聞者，盡爲流涕。王允第二日酒醒，聞聽百官議論，方自猛醒，後悔莫及。消息送至蔡府，蔡琰當即暈倒。家中一片混亂，多有趁機攜帶财物私逃者。幸得老仆忠直，多有擔當，方得保全。
且說李、郭汜、張濟、樊稠逃居陝西，使人至長安上表求赦。王允見表，遂聚大臣商議。皇甫嵩出班，道“今董賊伏誅，天下方定，可暫赦之。更遣一将前往鎮之，西涼可安矣。”
王允沉思良久，道“昔日董卓神作書吧亂，皆此四賊爲輔。我今欲解散西涼衆軍，衆皆可赦，獨不能赦此四人，待将此四人斬之，西涼衆軍無首，天下立可定也。豈用靡費許多時日？”遂不聽勸解。
使者回報李。李大驚，道“既不得赦，吾等隻好各自逃命去吧”。待要走時，卻被一人攔住，李看去，卻是謀士賈诩。
賈诩字文和，武威姑臧人也。年少時很少有人知道他，唯獨漢陽閻忠知道他的才能，盛稱賈诩有張良、陳平之奇。後被當時西涼太守董卓知道，延其入軍。賈诩之才，實爲當時頂尖謀士。後人陳壽曾評道“庶乎算無遺策”。因其出謀，狠辣穩準之至，少留人活路，多有毒士之稱。
董卓入洛陽時，賈诩以太尉掾爲平津都尉，遷讨虜校尉之職。時董卓之婿中郎将牛輔屯兵于陝，賈诩便在牛輔軍中輔
及至董卓被誅，李退回西涼，便取賈诩爲謀士。賈诩身即屬董卓一黨，聞聽朝廷不赦，又聽蔡邕之事。爲求自保，遂拉住李，講出一番話來。
賈诩道“我聽聞，長安城中商議欲盡誅董公一系之人，單隻見蔡伯喈先生之下場便已盡知。今諸君棄衆單行，即便一亭長也能将你們輕松拿住，繼而送命。若想活命，唯有一搏。不若誘集陝人并本部軍馬，殺入長安，與董卓報仇。若事成，就奉朝廷以正天下；若其不勝，那時再走也是不遲。”李等大喜，按計行之。
賈诩這番話卻隻是爲自己考慮，毫未考慮他人死活。正因這番話，給人民帶來了無窮的災難，使東漢再次陷入了混亂狀态。裴松之在給三國志神作書吧注的時候說：“當是時，元惡既枭，天地始開，緻使厲階重結，大梗殷流，邦國遘殄悴之哀，黎民嬰周馀之酷，豈不由賈诩片言乎？诩之罪也，一何大哉！自古兆亂，未有如此之甚”。這個評價卻是極爲中肯的。
與此同時，琅琊帽子峰上，柳飛亦是召喚金翅，徑往長安而來，要接蔡邕一家回來。。