寺廟裏敲鍾的規矩都是一樣的，正像宋朝詩人陸遊說的那樣：百年鼎鼎世共悲，晨鍾暮鼓無時休。所謂晨鍾暮鼓，并不是很多人以爲的那樣，早上敲鍾晚上敲鼓，而是不論早晚，都既要敲鍾又要擊鼓。
早晨和晚上所不同的是，早晨是先敲鍾後擊鼓，晚上是先擊鼓後敲鍾。早晨在卯時敲鍾，也就是早晨五點到七點間，太陽升起的時候；晚上在酉時敲鍾，也就是下午五點時至七點間，太陽下山的時候。
敲鍾的方法是緊敲十八下，慢敲十八下，不緊不慢再敲十八下。如此反複兩遍，共一百零八下。爲何要定爲一百零八下呢？一種說法是一年有十二個月、二十四個節氣、七十二個候（五天爲一候），合爲一百零八。鍾鳴一百零八響，象征一年輪回，天長地久。另一種說法是，人有一百零八種煩惱，鍾鳴一百零八響，以盡除人間煩惱。
除此之外，金山寺裏的鍾還有另外一個敲法，隻敲兩長兩短四下。這是在寺中有大事發生時，通知全寺僧人集合用的。此時已是深夜，金山寺内鍾聲驟然響起。當僧人們聽到兩長兩短的四聲鍾響時，便知道寺中有大事發生。衆僧顧不得深夜，連忙起身穿衣，來到大雄寶殿集合。
大雄寶殿是金山寺的主體建築，建于明朝時期。大殿歇山重檐，雕梁畫棟，黃牆紅柱，金色琉璃屋面，白石柱礎欄杆，氣勢雄偉莊嚴。大殿爲正方形，殿高和殿深都是八丈一尺，殿内三十六根子柱擎立。金山寺的大雄寶殿既有北方宮廷雄渾富麗氣勢，又有南方園林精美雅緻的風格，大殿外牆書“莊嚴國土，利樂有情”八字。
殿内正中供奉的是釋迦牟尼佛，阿彌陀佛和藥師佛分立兩側，再兩旁爲十八羅漢。背面爲南海觀音像，兩旁站立善财童子、龍女。中有金山寺德雲比丘，金山寺海島圖也在其中，特别引人。大殿上方四周，圈棚列出五十六尊羅漢。日本兵來到殿中，頓時感覺到莊嚴的佛教氣息，身上的煞氣立刻弱了很多。
不一會兒功夫，方丈看僧人到齊，清了清嗓子說：“這麽晚叫大家起來，因爲剛剛有一個逃犯藏到了寺中，這是皇軍親眼所見。大家安心在殿中念一會兒經，待皇軍搜查完畢之後，再回去歇息吧！”
說完，住持自己在大殿正中的蒲團上盤膝坐下，開始專心誦經。寺中僧人一聽，立刻交頭接耳的議論起來，大殿中頓時響起嗡嗡的議論之聲。
方丈用力敲了敲木魚，高聲說：“别吵了，都趕快坐下誦經吧！”一個執事僧站出來說：“方丈師兄！我等睡下之前，并未見寺中有人進入，睡下後也沒聽到任何動靜。方才我問了知客僧，他說從未開過寺門，怎麽會有賊人進入寺中呢？”方丈重重敲了敲木魚，嚴肅的說：“不要說了！就讓皇軍去搜一搜，大家都坐下念經吧！”衆僧隻好依言坐下。
日軍小隊長滿意的點了點頭，帶着十個手下離開了大雄寶殿，開始在寺中搜查起來。待日軍離開大雄寶殿之後，方丈這才歎了口氣，語氣沉重的對衆僧說：“你們别看日本人表面上客客氣氣，其實那隻是他們敬畏我佛，并不是因爲咱們這些僧人。如果不順着他們，恐怕會爲寺院惹來禍端的！雖說日本人追捕的，肯定是抗日志士。但我們沒看他來到寺中，更不知道他藏身何處，實在無從遮掩啊！”
日軍憲兵小隊失去了軍犬，無法再靠狗鼻子追蹤，現在也隻能靠人眼了。小隊長無奈的吩咐道：“大家分頭搜吧，三個人一組，小心那人的偷襲。我和副隊長在院中盯着，防止他趁機溜走！”
九個憲兵分成了三組，一間房一間屋，仔細的搜索起來。寺中僧人都已經到大雄寶殿集合，所有的房間裏都是空無一人，他們搜了一會兒毫無發現。金山寺房屋并不多，日本兵很快就搜完了所有的僧舍，隻剩下一座慈壽塔沒搜了。
慈壽塔又名金山塔，建于一千四百年前的南朝齊。唐宋時期本有雙塔，叫“薦慈塔”、“薦壽塔”。1472年，日本畫家雪舟等楊曾經登遊金山，繪制了《大唐揚子江心金山龍遊禅寺之圖》，圖上有南北相向的兩座寶塔。慈壽雙塔後毀于火，雙塔倒坍後，明代重建一塔，取名慈壽塔，到清代鹹豐年間此塔又毀。
光緒二十年，金山寺住持隐儒和尚誓建此塔，去北京向清廷呼籲，慈禧命他自行募捐修建。他奔走南北，沿門托缽，多方募化，并得到兩江總督劉坤一的支持。曆時五年，終于募銀二萬九千六百兩，重建後仍名慈壽塔。此塔玲珑、秀麗、挺拔，矗立于金山之巅，和整個金山及金山寺配合得恰到好處，仿佛把金山都拔高了。
慈壽塔外的花牆上，刻有“天地同庚”四個大字。這四個大字寫于清代光緒年間，是湖南一位八歲兒童李遠安所書。相傳，當年塔建成之時，正逢慈禧太後六十歲壽辰。爲了賀壽，兩江總督劉坤一特地進京朝見慈禧，獻媚道：“老佛爺六十大壽，臣沒有什麽厚禮。隻是在江南鎮江金山上造了一座寶塔，取名慈壽塔，祝您長壽萬歲。”
慈禧心想，這寶塔标上她的名字，兀立在江南名山之巅，實在是非同一般壽禮，不由漸露喜色。便問劉坤一：“你祝我長壽，我很高興啊！萬歲是不可能了，那你來說說，我能活到多少歲啊？”
劉坤一聽了慈禧太後的話，立時張口結舌，無言以對。他心想，無論說多說少，都不合适。說多了是欺君之罪，說少了是咒慈禧短命，都會招來殺頭之罪。正在他左右爲難的時候，有一小孩從身後很敏捷地遞給他一張紙條，他一看如獲至寶，迅速呈上。
慈禧接過紙條一看，原來是“天地同庚”四個大字，便喜笑顔開，大大獎賞了劉坤一。這個小孩正是李遠安，是劉坤一的侍童，小小年紀就寫的一手好字。後來劉坤一回到江南，既是感念李遠安的機靈，也是爲了恭維慈禧太後，便命人将這四字刻于慈壽塔下。
日軍小隊長望着巍峨的高塔，心中一陣慨歎。日本雖然近年來國力突飛猛進，但錢都花在了軍隊和工業上，文化和底蘊與中國相比還是相差太遠。感慨了一會兒，小隊長剛要帶人進去搜查，住持匆匆趕來了。
住持氣喘籲籲的說：“施主，這塔搜不得啊！塔中供着兩顆千年舍利子，乃是佛家重寶，施主萬萬不可冒犯啊！再說這座塔隻有一個門，藏身其中如同甕中之鼈，就算你們要搜的人真在寺中，也不可能蠢笨到如此地步吧。”
小隊長搖了搖頭說：“大師，這塔我們是一定要搜的！不過，你滴放心，我們是不會冒犯舍利子的。”說完，他命令兩名士兵守住門口，親自帶人入塔搜查。人爲刀俎我爲魚肉，住持也無可奈何，隻好回大雄寶殿繼續念經去了。