《内景經》還對《存思法》進行詳細闡述。早期道教《太平經》中就有存思五髒神萬病都可消除的說法，《内景經》繼承這一思想并加以進一步發揮。認爲“存思百念視節度”，即要求存思身中百神，呼吸上下如一而除雜念。并認爲“可用存思登虛空”，這是把存思之法當作學仙之道。可以說，存思是道教上清派典型的修煉方法，也是《内景經》的核心内容。所謂存思之法，《内景經》中包含兩個方面内容，一是指存思身内諸神，另外指存思身外之物。

道教認爲人體多神，而以五髒神爲主，故重視存思五髒神的色、形、氣、服飾、姓名等。《内景經》對于存思心、肝、脾、肺、腎等五髒神，都分别加以論述，其中對存思心神的論述最多。如經中述道：“心典一體五藏（髒）王，動靜念之道德行，清潔善氣自明光，坐起吾俱共棟梁，晝日曜景暮閉藏，通利華精調陰陽。”這是認爲心有神靈，且是五髒之王，倘若經常存思心神，那麽陰陽和順，髒腑調勻，均無疾病。存思肝神：“肝氣郁勃清且長，羅列六府生三光，……五色雲氣紛青蔥，閉目内眄自相望。”

肝屬東方木位，主青，故肝氣旺盛清而且長時，如東方之木主春，肝爲生氣之本，閉目冥想生氣遍照體内五髒之腑，與髒腑相應，上爲五色雲，如日月星辰光亮明徹，久久即可自己内視髒腑。“内視”是存思法中一種重要思想，就是指修煉者閉目存思，潛神入定後，内觀形體，神氣充溢而使體内朗然洞徹的景象。關于存思脾神：“脾長一尺掩太倉，中部老君治明堂，……黃衣紫帶龍虎章，長精益命賴君王，三呼我名神自通。”脾居中宮，存思脾神，即可增長精氣，延長壽命，心虛洞鑒，神靈自通。關于存思肺神：“肺部之宮似華蓋，下有童子坐玉阙。……素錦衣裳黃雲帶，喘息呼吸體不快，急存白雲和六氣，神仙久視無災害，同之不己形不滞。”肺爲金宮，在五髒之上，狀似華蓋。

童子、白雲都是指肺神。當喘息不定呼吸不暢、身體不快時，就趕緊存思肺神，便能調和六氣而無災害，常用此道，可保形體不枯衰。關于存思腎神：“腎部之宮玄阙園，中有童子冥上玄，……蒼錦雲衣舞龍幡，……百病千災急當存，兩部水王對門生，使人長生■九天。”腎爲水宮。玄阙園，喻指腎之外形。童子、水王都是指腎神。當人正生病時，就應立即存思腎神，這樣便能逢兇化吉，免除疾病而能升天成仙。

“三丹田”　《内景經》提出“三丹田”之說。關于三丹田之名，在此經之前的早期道教籍中尚未出現。《太平經》、《大洞真經》提到泥丸、心、臍等與之相關的名稱，隻有到了《内景經》才明确提出“三丹田”的概念。丹田有上、中、下之分，故合作“三田”。每一丹田中各居着一位神，故有“三神”。又因丹田之室，方圓一寸，故稱寸田，下面分别簡介三丹田。

一是關于吐納行氣的方法。《外景經》在《内景經》的基礎上，繼續強調這方面的内容，如“象龜引氣至靈根”，“呼吸廬間入丹田”，講的是人應當效法長壽之龜，引氣到丹田，以保持體内元氣。又如：“人盡食谷與五味，獨食太和陰陽氣”，“呼吸廬間以自償，子保完堅身受慶”，講的是常人都吃五谷，品五味，而修煉黃庭經者的形狀隻食太和陰陽氣，以充實體内元氣，經常這樣做，就會使元氣充足，神氣合一身體健康無損。

二是關于咽津和寶精、固精的問題。道教常稱津液爲玉液、玉漿、醴泉、靈液等，認爲此液由煉氣而産生，是五髒之精華，甜美清香。若人們勤加修煉，漱津咽液，那麽就以去病防病，強健身體。《外景經》很重視津液的作用，如“玉池清水灌靈根，審能修之可長存”，“玉池清水上生肥，靈根堅固老不衰”，“津液醴泉通六腑，随鼻上下開兩耳，窺視天地存童子，調和精華治發齒，顔色光澤不複白”，可見經常叩齒咽津，可使齒堅發亮，童顔常駐，其妙無窮。曆來道經甚重視寶精、固精的問題，《太平經》主張“人欲壽，當愛氣尊神重精”，《内景經》也強調說：“急守精室勿妄洩，閉而寶之可長活。”《外景經》也強調固精、寶精的意義，如“長生要慎房中急，棄捐淫俗專子精……閉子精門可長活”，“急固子精以自持，……精神還歸老複壯”。

三是恬淡無欲的思想。《外景經》反複強調這種思想，并在數處加以闡述：“物有自然道不煩，重拱無爲身體安，虛無之居在帏間，寂寞廓然口不言”，“扶養性命守虛無，恬淡自樂何思虛”，“近存子身還自守，清靜無爲神留止”，“恬淡無欲養華莖，服食玄氣可遂生”等等，這些都強調修煉者要恬淡無欲，清靜無爲、虛靜自守。這些思想是對以老莊爲代表的道家哲學思想加以繼承，并有所發展，運用于存思修煉中。<