“總兵大人！”率領明定号船隊的自然是蘇州鎮海衛衛指揮使羅海，領着船隊的一幹将領前去拜見了抵達港口的李雲天。
羅海已經聽說了明軍在三江府的兩場大捷，這使得他對李雲天是愈加得敬佩，很顯然這兩場勝仗是李雲天指揮的，交趾的那些明軍将領們早就被叛軍給打懵了，看來李雲天并非浪得虛名，确實有着卓越的軍事才華。
由于明定号船隊的運輸能力有限，每次最多隻能運送六七千名百姓，而按照行程來算的話，從蘇州太倉港啓程的大明水師要在一個多月後才能抵達清化港，因此清化城的軍民們不得不逐批離開。
按照李雲天的命令，隊伍中的老人和婦女兒童先走，其餘的人在清化港就地紮營，按照次序依次離開，軍隊負責壓陣，最後登船。
爲了能保證聚集在清化港的軍民們能過得安心，李雲天特意用明定号從新安府調來了糧食，徹底解決了大家的吃飯問題，極大地安撫了百姓們的情緒。
至此，清化府出現了交趾戰場上的一大怪異現象：十幾萬明軍軍民圍聚在清化港，而清化城裏的叛軍則視若無睹，眼睜睜地看着那些軍民相繼乘船離開。
清化城明軍軍民的這次撤退後來被史學家們稱爲“清化大撤退”，成功撤離了清化府的這十幾萬軍民日後成爲了重建交趾的一支重要力量，對穩定和發展交趾具有重要的戰略意義，因此被後世之人交口稱贊。
與此同時，清化大撤退也成爲了後人懷疑李雲天與黎利在交趾戰場上有秘密協議的重要佐證，但由于不是直接證據，故而無法證明叛軍不追擊與李雲天有關，或許叛軍是貪圖清化城裏的安逸生活而不想再與明軍死戰。
根據清化府史料的記載，叛軍将領進城後立刻瓜分了那些逃走的大戶人家房産和商鋪，這也從側面表明了叛軍已無追擊明軍軍民的心思。
李雲天一直在新安府待了一個多月才離開，由于清化城出來的軍民不願意再跋涉去宣化府和太原府等地，因此紛紛留在了新安府。
雖然一下子多出來了十幾萬人，但新安府府衙并沒有慌亂，而是有條不紊地将那些清化城軍民在新安府境内妥善安置。
這并非是新安府府衙辦事效率高，隻是新安府府衙在執行李雲天的安置方案而已，在來交趾之前李雲天就已經考慮到了清化城軍民撤退後的去處，故而将新安府作爲了重要的安置點。
宣化府和太原府等地雖說也是李雲天的備用安置點，但自古以來百姓們就不喜歡背井離鄉，故而李雲天就将精力放在了新安府上。
新安府此時已經從廣西調來了大量的糧食、農具和生活用品，足以确保清化城軍民的衣食起居，因此百姓們情緒穩定，秩序井然。
随着黎戈率軍進入清化城，黎利暗中給諒江城叛軍守将下令，讓他将主力部隊調往交州城，以防明軍突襲，并且派來了一名心腹将領接替其在諒江城的防務。
諒江城叛軍守将自然不清楚這是黎利調虎離山的計策，因此率領着諒江城的叛軍主力馳援交州城。
就在諒江城叛軍主力走後的第二天，新安府和諒山府的明軍集結了一萬兵力，回合後向諒江城進發。
諒江城裏此時有七千多名叛軍，按理說他們憑借着諒江城的城防完全可以固守待援，可是新任諒江城叛軍守将卻下令棄城而逃，帶上忠于叛軍的軍民離開諒江城前往交州府。
這使得明軍不費吹灰之力就得到了諒江城，原本有明軍将領主動求戰，想要追擊逃走的叛軍軍民，但是卻被領軍的明軍主将拒絕，讓他們前去收複諒江府下屬的各州縣。
因此，在李雲天和黎利的默契配合下，諒江城的叛軍軍民順利進入交州府境内，這意味着兩人的合作有了一個良好的開端。
自從宣德帝下令王通率軍來交趾平叛以來，這還是明軍第一次奪回一個府的治所，使得新安府、諒山府、建昌府、太原府、宣化府和三江府等明軍控制地區的軍民大受鼓舞，士氣大漲。
與此同時，從蘇州趕來的大明水師抵達了雲屯港，一共有大大小小的船隻近百艘，密密麻麻地停泊在雲屯港港口處，吸引了衆多百姓前去看熱鬧，群情興奮，士氣随之高漲。
在李雲天的推波助瀾下，骁武軍已經乘坐海船趕來新安府并且參與了攻打諒江城的消息不胫而走，既鼓舞振奮了明軍軍民，也使得叛軍大吃了一驚，萬萬沒有想到大明竟然會調水師來運兵。
由于大明水師的任務是運送停留在清化港的明軍軍民，故而交趾東部沿海的新安府、建昌府、奉化府和清化府的百姓皆目睹了浩浩蕩蕩行駛在近海海面上的水師編隊，雄偉壯觀，震懾十足。
随着諒江城的失守，黎利率軍緊急抽掉了一部分圍困安梁縣城的叛軍回交州府待命，以防明軍的突襲。
當明軍水師的船隻出現在新安府等地的消息傳到小河鎮時，黎利立刻召集了叛軍将領開了一次高級會議，最終決定固守交州城全力應戰抵達的骁武軍。
因此，在會議結束的第二天，圍困安梁縣城兩三個月的叛軍開始拔寨啓程，退回了交州府地界的立濂城，在立濂城屯兵三萬防備三江府的明軍。
等确定了叛軍撤退，安梁縣城的明軍軍民頓時歡呼雀躍，他們原本以爲要在安梁縣城經曆一場血戰，誰也沒有想到叛軍竟然會撤退。
後來他們才聽說了骁武軍已經乘坐大明水師的船隻來交趾的事情，立刻群情振奮，士氣高漲，以前失利的陰霾一掃而空。
自此，明軍與叛軍在交趾的對峙态勢正式成形，按照與李雲天的約定，黎利逐漸撤回了那些在明軍控制地盤内的叛軍，雙方的界線逐漸清晰起來。
李雲天也遵守了協議，而且在三江城和諒江城的駐軍都隻有約定的一半，即各五千人，以示自己無意進攻叛軍，讓黎利放心。
其餘的明軍被李雲天撤到了太原府和新安府進行整編，他對交趾的駐軍進行了大刀闊斧的革新，不僅淘汰了軍隊上的老弱病殘，而且還對交趾軍戶進行了一項重大改革，那就是允許交趾軍戶不用參軍，而已從事講武堂下屬産業的經營作爲代替。
換句話來說，李雲天實際上已經廢除了交趾的軍戶，隻不過沒有明說而已。
他這樣做有着充足的道理，畢竟交趾不同于大明的兩京十三省，其人口以交趾當地土人百姓居多，因此大明要想真正将其治理好并不能單單依靠武力，當務之急是通過那些從内陸遷移而來的居民來發展交趾的農業和經濟，以此來打開局面。
因爲交州城已經被叛軍占領，故而李雲天下令交趾布政使司、按察使司和都司等衙門前往太原府太原城公辦，以太原城爲交趾的臨時治所。
宣德三年二月底，曆經十餘年叛亂的交趾終于平靜了下來，明軍和叛軍紛紛進入了休整期，像兩頭激烈厮殺後疲憊的野獸各自****着身上的傷口。
與此同時，明軍和叛軍都将事務的重點轉移到了農業和經濟的建設上來，連年的戰火已經使得不少百姓食不果腹，雙方都要抓緊時間來解決糧食問題。
雖然黎利與李雲天私下裏達成了協議，但他并沒有掉以輕心，暗中積蓄着力量，不僅像李雲天一樣開始整軍，而且還與橫行在南洋水域的海盜取得了聯系，通過那些海盜與南洋諸國進行海上貿易來獲取利潤，用來支撐叛軍的各項開銷。
黎利這樣做是逼不得已，由于他正在與大明打仗，故而周邊的占城、真臘等國都不會與其交易，他也隻能将目光投向海外。
李雲天并沒有理會黎利的海上貿易，在他看來黎利這樣做隻是解了燃眉之急而已，并不能真正解決叛軍的财政壓力，除了叛軍的軍需外，叛軍轄地内百姓的安置和救濟都需要錢财，這将使得黎利爲此頭疼不已。
這個時候，大明作爲天朝上國的優勢就彰顯了出來，李雲天不僅從廣西的官倉調來了大批救濟給轄地内的百姓，而且還免除了轄地内百姓兩年的賦稅徭役。
當免除兩年賦稅徭役的消息一出，明軍控制州府内的百姓頓時一派歡騰，這意味着他們兩年之内沒有了田賦和丁稅，可以安心從事各自的事務，所有的收入和守城都将歸個人所有。
由于沒有了田賦和丁稅，交趾三司和各地方衙門的開銷将由李雲天籌集的平叛大軍軍費來支付。
爲了彌補免除田賦和丁稅後的交趾地方衙門的财政壓力，李雲天以定南将軍的名義正式下發了《交趾商事法》，既規定了在交趾境内的商貿活動受講武堂交趾商務司保護，同時也明确規定了新的商業稅率，包括茶、鹽、布料和礦石等商品的稅率。
新稅率與李雲天在揚州競拍交趾商業專營權和采礦權時制定的一樣，遠高于大明兩京十三省的稅率。
其中，尤爲引人注意的是李雲天在交趾成立的一個新衙門――講武堂交趾商務司。
講武堂交趾商務司不僅統掌了交趾境内的商業事務，而且還接管了雲屯市舶司，将原本由交趾布政司管轄的雲屯市舶司納入到了講武堂交趾商務司的麾下，權力之重可見一斑。