少林寺内，與燕狂徒一同實現少林派和武當派兩大門派屏棄成見，互相交流武學，以達到抗争邪道的目的。
嶽飛被捕後，蕭秋水毅然獨闖「牢」，過關斬将後，在最後一層從「鐵索橫江」朱順水口中得知，嶽飛已被押至「風波亭」。
蕭秋水趕至「風波亭」，卻親眼見到兩位同來救嶽飛的知己被殺，痛不欲生，而勾結金國的「朱大王」朱俠武暗裏偷襲重傷了蕭秋水，危急時刻，「三才劍客」聯手彈奏一曲《滿江紅》，使蕭秋水振作，擊斃強擔
但是蕭秋水得知，在他趕赴「風波亭」的路上，昏君『奸』臣已在「牢」殺害了嶽飛。
而前去攻打「牢」的結義兄弟邱南顧也不幸戰死，紅顔知己唐方卻被「蜀中唐門」門主唐老太太囚禁，不許她再見蕭秋水。
連番遭受打擊的蕭秋水，見宋室頹靡，禍亡無日，感歎於「入鄉有黨排宗澤，帷幄無人用嶽飛」，隻身飄然遠去，「神州結義」也一蹶不振了。
當其時朝政日非，蕭大俠雖不求聞達於諸侯，不見得也不管下不平事，亦繼續些遊俠江湖，行俠仗義。
續傳
在續傳中，蕭秋水爲見唐方，獨身闖「蜀中唐門」，蕭秋水決鬥唐老太太。
這一場戰，蕭秋水并不願意，他是爲見唐方而戰，因唐老太太是障礙；也同時是爲江湖而戰，因唐老太太顯然要使「唐門」變成獨霸下，暗中殘害各大門派精英。
唐老太太則非殺蕭秋水不可，蕭秋水不死，萬衆歸心，「唐門」稱雄成泡影。
雖然，在決鬥前，蕭秋水獨闖「唐門」的勇氣，及與唐老太太共禦「江南霹靂堂」的侵略，已使這一老一少兩人，相惜相重——但決鬥勢在必校
唐老太太自知并無把握可勝蕭秋水，所以要求蕭秋水在地牢一戰，以該處有唐老太爺子爲餌——其實這一戰，唐老太太早已準備無論蕭秋水赢輸，都不能讓他活着出去。
所以她毀碎了來時的機關。
而出路的機關，在裏面的人，是斷斷開啓不到的，縱蕭秋水有蓋世之能，也無法自内将這奇鐵鏽成的地獄『穴』破而出。
這一場決戰，唐老太太雖然出動了唐老太爺子，但仍是殺不了蕭秋水，唐老太太亦力竭而死，但她以最後暗器的威力，使得蕭秋水一時失去了活動的能力，而曆年在地底守護「唐老太爺子」的六名唐門死士：唐看、唐聽、唐聞、唐涪唐舌、唐思，一擁而上，分别鉗制蕭秋水四肢，當時，唐看因激烈交戰情況，被誤傷而雙目俱盲，神智喪失，反而得在機關未發前走出地道，唐思則在唐老太太最後一道暗器發出時斃命，本來「唐門六識」一齊出手，被他們所制住的人，不能想，不能吃，不能動，不能感，不能聞，不能視，形同廢人，必死無疑。
可是，「唐門六識」己去其二，僅馀其四，隻能夠在蕭秋水擊敗唐老太太後真力耗盡一時未複之際制佐他而已，要殺害蕭秋水，卻是不能。
唐老太太臨終之前，尚不放心，這被江湖人稱作「最有實力，最有神秘力量和武功最高的女人」，臨終之前，了如下的詛咒：
「蕭秋水，雖然你有七十二變之能，過人之勇，助人之義，萬世之功，都不能活着走出唐門地牢，我舍這條老命與你陪葬，除非爲之裂，地爲之陷，唐門不複，聖人門徒七十二複出，以狂人燕某不世掌力，并有人爲求你之複生而不惜死……方可破壁而出……」唐老太太罷這一番話，狂笑而死。
她的詛咒完全應驗，蕭秋水從此在地牢中，因功力未複前被唐門四識所制，他既掙脫不出，但對方也殺不了他。
但他意識未滅，在牢中生涯，仍是可以思索，思念唐方；他的内功未失，雖不能發，卻依然存在、休息。
這便是《蜀中唐門》故事中的「結局」。當然，那一場厮殺，是武林中最精彩凄厲的一戰，是以才換來一代名俠的漫長等待。
經過七年生死磨難後，終于有情人終成眷屬。
外傳
中元夜，華山之巅，蕭秋水列爲生平奇險的三戰之一：「雷老人」之役，蕭秋水與一生從未敗過的「雷老人」範式論劍，他的「雷一式」也從未有人接得下，苦戰一晝夜，「雷一式」竟敗在這位劍俠的一招下。
那一招正是武林中見所未見，卻已風聞下的：「驚一劍」！蕭秋水刺了那一劍後，「雷老人」俯首稱臣，從今以後，蕭秋水再也沒有出現過江湖。
蕭秋水年老之後，見黑白二道，争持不已，于心不忍，便「單劍鬧血河」，以垂幕之年，力戰「血河派」高手，最後勇鬥「血河派」曆代以來未出之英傑「血蹤萬裏」衛悲回，結果以「驚一劍」把衛悲回打入龍門急流之中，但自己身受重傷，内力也大爲耗損。
血河派弟子及「幽冥血奴」蕭蕭等悲哀之餘，驚戰蕭秋水，抑仍不敵，銳氣大滅，蕭秋水飄然而去後，但因受極重的内傷，另一方面在此場殺中心灰意懶，便不出江湖。
直至蕭秋水欲覓傳人，卻遭人用毒暗算，受傷之餘，遭「幽冥血奴」蕭蕭萬裏尋仇，終于遇了蕭秋水，都被蕭秋水所擊敗，蕭蕭舊恨新仇，痛斥蕭秋水，蕭秋水劫靜靜待他斥責完後，詳述往事。蕭秋水并無殺死蕭易人，蕭易人之死，乃咎由自取。
至于衛悲回之死，是公平決鬥後，衛悲回失足落下龍門，并非蕭秋水有意手齲蕭秋水完後，即閉上雙目，任由蕭蕭處決，蕭蕭因感于潇秋水爲人，前嫌盡釋，蕭秋水飄然而去。
後再遇武林第一狂人「武林孤子」任狂，展開一場激鬧，結果不知，蕭秋水卻從此未現江湖。
《血河車》最後部分，蕭秋水至峨眉山懷念唐方的時候，竟然是人未到而風雲爲之『色』變！