小智：

刺刺耳皮丘：小智的初始神奇寶貝，是由大木博士給的蛋裏孵出來的，特性是避雷針，左耳上有三個刺刺，不可以進化，可以學會許多普通皮丘無法學會的技能，小智一直攜帶的神奇寶貝。

迷你龍——哈克龍：野生原野區收服，後來打敗水晶大岩蛇而進化爲哈克龍。

河馬王：巨大神奇寶貝之島收服，後來通過攜帶王者之證通信進化爲河馬王，智慧較高，能舉一反三，學習力較強。

伊布——月精靈：彩虹市遊戲廳兌換而來，在化石盔之島沐浴在紅色的月亮之下而進化。

伊布——太陽精靈：彩虹市遊戲廳兌換而來，在神奇寶貝豪華遊輪打敗火箭隊而進化。

蛋——好運蛋——吉利蛋：彩虹市遊戲廳兌換而來的蛋，在奈普魯島小智與小霞确立關系的夜晚孵化爲好運蛋，是幸福的見證，在大神奇寶貝之島攜帶圓石打敗火箭隊進化爲吉利蛋。

大嘴雀：真新鎮外的森林收服，是烈雀群的老大，剛剛進化而來。

超夢：自己歸來，願意跟随小智，一直呆在小智身邊。

走路草——臭臭花——美麗花：是在内木博士那裏收服而來，後對大鯉魚王使用了睡眠粉後進化爲臭臭花，在柚子島用太陽石進化爲美麗花，因爲水土原因，顔色鮮豔異常。

乘龍：因暴風雨而走失的乘龍，後來小智舍身救它，從而跟随小智。

水晶大岩蛇：椪柑島的水晶洞窟中收服，因爲長期的變異，地面屬性轉換爲了水屬性，不過由于本身是水晶的緣故而非常的怕火，是一個另類的存在。

哥達鴨：哈撒島收服，本身非常的喜歡漂亮的女生。

大鯉魚王——大暴鯉龍：擱淺的大鯉魚王，小智因此收服，後來在小智的指揮下打敗了火箭隊而進化，是喬伊小姐從小的玩伴。

白海獅：小智在幫喬伊小姐忙的時候，在水中收服的。

卡比獸：果實七島中收服，是大胃王。

飛天螳螂：馬克特島收服的飛天螳螂群的新的老大，臉頰上有十字形疤痕，實力強勁，不服輸。

三合一磁怪：小橘子島的大平原收服，原先是佛得先生的神奇寶貝，不過小智救了它，而且它喜歡小智，小智向佛得先生讨要了過來，它的磁鐵不是筆直的，邊緣向外彎曲。

大比比鳥——大比雕：在大神奇寶貝之島收服，後來在大木博士研究所打敗小茂的伊布而進化。

大鐵甲暴龍——大超鐵暴龍：在大神奇寶貝之島收服，後攜帶保護甲通訊進化而來。

小霞：

波克比——波克基古、角金魚——金魚王、墨海馬——海刺龍——刺龍王、瑪瑙水母、可達鴨、蚊香蝌蚪——蚊香蛙、菊石獸、暴鯉龍

小剛：

超音蝠、六尾、小磁怪——三合一磁怪、化石盔、海星星

小建：

毛球、瑪力露、飛天螳螂

武藏：

阿柏怪、大舌頭

小次郎：

雙彈瓦斯、大食花;