即使江西省政府仍以南昌爲省會，複興會的重心仍在九江。複興會總部、左七軍軍部、右二軍軍部、中興公司總部等重要機構都設在九江。
結束南昌之行後，吳捷一回到九江，便指示在全黨、全軍、江西省府推動一場聲勢浩大的整風運動。
吳捷之所以急于推動整風運動，主要有三方面的考慮。
第一，複興會驟然占領江西全境，尚未完全消化吸收。境内還殘存着大量的封建殘餘，省府亦留用了大量的舊官僚。
之前戰事發展太快，複興會大量吸收新會員，左七軍、右二軍也留用了不少湘軍、綠營軍官。由于時間倉促，複興會來不及仔細甄别，導緻各級機構混入了不少異類分子。
複興會對新會員的教育不夠深入持久，不少人還存留着大量的投機心理、自由主義傾向，對複興的組織性、紀律性認識不足。
種種弊端，從諸多迹象中都能窺見一二。
如，前任巡撫文俊在老百姓中尚有較大威望，能夠輕易斥退轎夫。如，南昌士紳當場請吳捷爲章江門改名、題字，背後似有小人作崇。再如，在個别地方，有些惡吏把持鄉政府，政令竟然難以下達。
第二，反對各種不良現象。
随着複興會對江西全境的占領，複興會、省政府、左七軍、右二軍都迅速膨脹，個别老幹部居功自傲，個别組織出現腐化現象。
複興會才占領一省，就出現諸多不良現象。若占了天京，豈不又要像李自成、像洪秀全楊秀清那樣迅速腐化？
必須未雨綢缪，展開一場強有力的運動，清除複興會中的不良現象，始終保持複興會的純潔性、紀律性、戰鬥性。
第三，如今已是8月上旬，太平天國天京事變即将爆發。屆時，吳捷将率軍前往天京靖難。在此之前，必須建立穩固的後方，防止後院起火。
按照職責，發動整風運動顯然要由政工部部長李雲牽頭負責。但整風運動勢必要得罪人，李雲又是女性，已經懷有身孕，顯然不便當此重任。
吳捷把這個任務交給了政工部副部長李珊元。李珊元兼有敵工處處長的職務，欣然受命。
讓敵工處處長在自己人中間推行整風運動，似乎并不合适。但時間緊迫，吳捷也不及提拔、培養新人，還是讓李珊元主持其事。
爲鄭重其見，吳捷指示成立一個整風工作小組，自己親任組長。李珊元以政工部副部長的身份擔任小組副組長。
熟悉複興會的人也凜然意識到：李珊元全面主持對敵工作，誰不支持整風運動，誰就将是複興會的敵人！
吳捷親自主持整風運動，由李珊元具體督促落實。
首先，明确整風運動的目的是什麽？主要有三個：
一要建強複興會各級支部，确保複興會的集中統一領導。
複興會的人數并不多，卻能在短短三年内脫穎而出，奪占江西全境，取得舉世矚目的成就。歸根結底，主要在于複興會是一個團結如鐵的、人才濟濟的先進政黨。
太平軍能夠以弱勝強，在清軍重重包圍之中保持擴張态勢，很大一部分原因在于楊秀清大權獨攬，能夠調集所有的資源對付清軍。
天地會遍布華夏，會衆不下數百萬，自清初便起義不斷，卻屢屢碰壁，毫無成就。這與天地會組織渙散，缺少集中統一領導關系很大。
複興會的事業不會止步于江西。她将打敗更多的敵人，占領更大的地方，統治更多的人口。爲此，必須堅定不移地建強各級複興會支部。
二要統一全會思想，消除會内雜音。
必要的争執、讨論是有益于發揚民主，有益于團結一緻，有益于集思廣益的。但是，複興會的領袖隻有一個，那就是吳捷。複興會的綱領也隻有一個，是全會所有人員都要堅定奉行、堅決維護的。
隻要是複興會總部通過的決議，下級支部、各個會員都要無條件的遵守、無條件的奉行。若有意見建議，要通過正常渠道，通過合法程序向上反映，不應發出牢騷怪話，影響團結。
例如，複興會總部決定推行簡體漢字、英語拼音。這有利于掃除文盲，有利于普及義務教育，有利于保障全體國民的受教育權利。
有人認爲此舉會破壞華夏傳統文化，甚至攻擊這是“以夷變夏”。也有人主張全盤西化，廢除漢字，使用英語作爲官方語言。
這些看法顯然都是錯誤的。既然總部已經決定要推行簡化漢字、英語拼音，各級支部都應鼎力支持，堅決貫徹落實，不能畏難不辦，更不能牢騷怪話一大堆。
三要克服宗派山頭，保持團結如一。
複興會壯大了，會員人數增加了，但會内也隐然出現了若幹山頭，影響全會團結。
例如，吳捷剛開始發迹時，部下多爲湖南人。這些湖南人把自己視爲“從龍之臣”，在左七軍中勢力很大。
很多團、營主官都是湖南人。這些湖南軍官刻意與湘軍降将交好，引起左七軍中其他籍貫的戰将的不滿。
宗派山頭的存在不利于軍令政令的統一，也不利于複興會的團結統一，必須堅決消滅之。
整風運動需要把握的重點是什麽呢？吳捷認爲主要在于以下四個方面：
一要掌握正确的方式方法。
曆史經驗表明，此類運動容易搞過頭，容易傷及無辜，容易擴大打擊面。若掌握不了正确的方式方法，很容易反噬自己，造成難以挽回的損失。
爲此，吳捷特意強調，決不能濫殺無辜，決不能借機打擊異己，決不能壓制正确意見建議。
若在整風運動中發現犯罪問題，必須移交法院，經法院審判、律師辯護後，方能定罪。
爲防止運動過火，整風運動領導小組會派出巡視小組，對開展運動的軍隊、政府、學校進行巡視，及時糾偏糾錯。
若有人認爲組織處置不公，可以向上級組織申訴，也可以向巡視小組反應問題。
二要堅持懲前毖後、治病救人的總基調，不擴大打擊面。
吳捷強調，大部分的複興會支部組織和會員都是好的，不存在大的錯誤、問題。對于運動中發現的犯了錯誤的組織和個人，要堅持懲戒與教育相結合，幫助同志認清錯誤、積極糾正錯誤。
對待可能犯錯的同志，不能含糊敷衍，不能似是而非，對就是對，錯就是錯，不能讓同志帶着思想包袱幹工作。
處理犯了錯誤的個人，要慎之又慎，小錯以教育幫帶爲主，大錯要移交司法機關，經法院審判後方可定罪。
複興會乃是一個新興政黨，大多數會員都是最近一年新加入的，對複興會的信仰還不夠堅定。因此，吳捷認爲，會員犯錯應以寬大爲主，隻要不是原則性的問題，隻要不觸及犯罪，都應在組織内部解決。
三要區分試點、推開、總結三個階段，由淺入深開展整風運動。
複興會從未開展過類似的運動，在這方面缺少經驗，不能盲目盲幹，一下子就在全會鋪開。
首先，要在複興會總部開展試點，總結經驗，探索方法路子。
其次，經過試點，總結試點經驗後，在左七軍、右二軍、省政府逐漸鋪開。之後，再在市以下政府、法院、咨政局、中興公司、學校等外圍組織内推開。
最後，全面總結經驗，形成運動成果。
四要結合運動，及時總結經驗，建立長效機制。
吳捷認爲，要優先建立幹部檔案制度、民主生活會制度、監察制度、思想教育制度。
要借助整風運動，清查幹部背景，了解幹部履曆，制定幹部檔案。檔案由上級負責管理，是複興會使用管理幹部的重要依據。
要建立民主生活會制度，定期開展批評與自我批評，發揚民主，團結同志。
要建立監察制度，對腐敗貪污、徇私枉法等行爲展開鬥争。各級支部應建立監察委員會，人數過少的支部，可設置一名監察委員。
要建立思想教育制度。各級支部委員會負有教育會員的職責，需定期開展思想教育，要求會員定期彙報思想。
曆史上，延安整風是一場偉大的思想解放運動，爲我黨奪取天下奠定了重要的思想基礎。
吳捷期待此次整風能夠發揮類似的作用，最起碼可以爲他鞏固江西根據地，進而幫助他入主天京。