庾亮到了尋陽，與溫峤會面後，兩人激動地抱在一起，熱淚盈眶。
庾亮流着眼淚說：“朝廷損兵折将，連連失敗，這都是我的罪過啊！我對不起先帝的信任，愧對他的重托啊！”
溫峤說：“元規不必過于自責，況且現在也不是追究責任的時候。我們眼下要做的是如何穩定軍心，徹底消滅叛軍，取得最後勝利。”
庾亮說：“嗯，溫太真言之有理。我來時，帶來了太後的诏書。現在請溫峤接诏。”
溫峤急忙跪下。
庾亮繼續說道：“宣太後诏：任命溫峤爲骠騎将軍、開府儀同三司；加郗鑒司空。”
溫峤答道：“謝太後恩典！但是請恕臣無禮：蘇峻之亂未平，溫峤不能接受這一任命。”
庾亮說：“太真請起。有話慢慢說。”
溫峤站了起來，從容說道：“那些亂臣賊子還沒有肅清，我有什麽臉面和資格升遷呢？我們應該抓緊聯合各地的軍隊，共同抗擊蘇峻、祖約的叛軍。我這裏有幾萬兵馬，我現在拿出一半來交給你指揮。另外，咱們聯合各地的軍隊，也該推舉一個盟主。依我看，盟主之位，非你莫屬啊！”
聽了溫峤一席肺腑之言，庾亮激動地熱淚盈眶。但他還是堅定地擺了擺手拒絕道：“感謝你對我的信任，不因爲我的重大失誤抱怨我，嫌棄我，還重新分派給我軍隊讓我掌握指揮權。但是你也看到了，我指揮失當，沒有軍事天分和經驗。所以我來這裏找你，就是想當殺滅叛賊、報仇雪恥的普通一兵，别提什麽指揮軍隊，更甭提讓我當什麽盟主了。我建議，盟主之位，由你擔任最爲合适。這也肯定是衆望所歸啊。”
兩人互相推讓了半天，也沒個結果。
這時候，一旁溫峤的弟弟溫充提出建議：“你們兩位不必推來讓去的了。你們兩個誰擔任盟主都不合适！”
庾亮愣了，急忙轉臉問道：“那你說誰合适呢？”
溫峤連忙介紹說道：“這是我弟弟、參軍溫充。”然後也問溫充，“我兩個都不合适，那你說吧，誰才合适當聯軍盟主呢？”
溫充說道：“陶侃最合适。陶侃是個老将，所處的荊州戰略位置非常重要，而且他的手下兵強将勇。這個時候，你們兩個都必須采取高姿态，把這個盟主之位讓給陶侃，争取他出兵才是上策。”
這時候庾亮、溫峤如夢初醒，恍然大悟。說道：“對啊，那現在就馬上給陶侃寫信讓他出兵，擔任聯軍盟主吧。”
于是兩人共同推舉征西大将軍陶侃擔任盟主，并派督護王愆期到荊州通知陶侃。
陶侃聽督護王愆期說了他的來意，看了溫峤、庾亮寫給他的信件，但是仍然對自己沒有被任命爲輔政大臣對庾亮及朝廷耿耿于懷，所以陶侃一口回絕了。
陶侃說：“我陶侃隻是一個邊城守将，并沒受到先帝托孤之重托。不但不被朝廷看重，而且深受朝廷懷疑。現在有了國難，又突然想起微臣來了。我這裏兵微将寡，本人昏聩無能，哪裏勝任得了聯軍主帥呢？還是希望溫将軍、庾将軍、王督護另請高明吧。”
王愆期哪裏還敢再說下去呢？隻好怅怅而歸。
後來溫峤又接連派出去四、五個人給陶侃聯系，陶侃雖然看起來有些猶豫，但都拒絕了。
溫峤對庾亮說：“既然陶侃這麽怨恨朝廷，不肯出兵，那咱們就最後給他去信通知他：你不參與讨伐，我們就不再等你了……”。
信已經送出去兩天，正好溫峤的參将毛寶從别的地方出使回來，聽說了這件事，他對溫峤說：“凡是舉大事，應當盡可能團結更多的人一起行動，而衆人要一起行動全在于團結，沒聽說互不同心能成功的。假如互相之間有疑慮，也應當表面上裝作不知道，怎麽能在内部之間制造疑慮呢！應該趕緊追回信使，修改原來的信，勸說他一定要一起征讨。如果追不上前面的信使，就應當再派使者另寫一封信糾正一下。”
溫峤猛然醒悟。于是溫峤就追回使者并再次修書，繼續痛陳利弊。精誠所至金石爲開，陶侃終于答應起兵擔任盟主，并派督護龔登領兵與溫峤會合。溫峤、庾亮于是傳檄天下，宣告蘇峻、祖約的罪狀。
駐守廣陵的郗鑒“革命”積極性非常高漲。他向溫峤派出使者，提出設立堡壘、堅壁清野、斷絕蘇峻軍糧食來源的策略，溫峤深表同意。
但是沒過幾天陶侃卻又反悔并追還龔登。
見此情景，溫峤隻有再度向陶侃寫信勸說。恰巧這時，陶侃的兒子陶瞻在與蘇峻、祖約叛軍作戰時被祖約的大将馮鐵殺死。溫峤在信中以其兒子陶瞻被蘇峻叛軍殺死的信息刺激陶侃，最終才令陶侃感悟，于是不顧兒子的葬禮，晝夜兼程，親自領兵前來與溫峤會合。
而徐州刺史郗鑒所在的廣陵糧少城孤，鄰近北方外族政權，故此士民都無堅定守戍的意志。但郗鑒收到庾亮給他的太後懿旨，獲知自己升任司空的诏書後當即感激流涕，“革命”積極性被充分調動起來。他迅速召開軍民誓師大會，号召起兵讨伐蘇峻，将士都争相要求參與。然後率兵向茄子浦開拔。
陶侃大軍到尋陽與溫峤合兵一處。衆人都議論紛紛：
“陶侃要殺庾亮以謝天下了。”
“蘇峻、祖約就是以殺庾亮爲名起兵的，這樣做，豈不是幫了他們的忙了？”
“新賬老賬一起算呗，怕是要追究這次朝廷軍隊節節敗退的責任吧？”
“庾亮這回夠受的。”
聽了軍民的一些街談巷議，庾亮也感到十分恐懼了。
溫峤提議：“既然是陶侃已經過來了，咱們就主動到他那裏去拜訪一下吧。”
庾亮感到害怕，說：“說實在的，我是有幾分膽怯啊！”
溫峤說道：“怕什麽啊？有我呢。非常時期，我想他陶侃是會顧全大局的。”
庾亮說：“其實我也沒什麽對不起他的啊，隻是以往對他缺乏信任而已。”
溫峤說：“即便你在朝堂采取一些措施，也是爲國家着想，并沒對他本人形成傷害。再說，顧命大臣的事情，他即便埋怨你也隻是個誤會，因爲要誰當顧命大臣不是你元規能決定的。”
于是庾亮隻好硬着頭皮跟着溫峤前去會見陶侃。
進到陶侃的将軍大帳，溫峤、庾亮跟陶侃一打照面，互相介紹已畢。
隻見庾亮冷不防從容跪倒在陶侃面前，說道：“陶将軍，元規給你賠罪來了！以往元規剛愎自用，不聽衆臣之良策，導緻朝廷軍隊節節失利。國家罹難，百姓遭殃，這都是元規一人之罪啊。罪臣元規作爲帶罪之身，肯請陶将軍作爲聯軍主帥，帶領聯軍讨伐叛逆。隻要讨逆成功，罪臣何惜這一項上人頭呢？那時定當以此向天下謝罪！”
陶侃一看庾亮玉樹臨風，氣質不凡，突然間玉樹傾倒，拜倒在自己面前，而且态度誠懇，悲悲切切，心裏的怨恨恨惱怒似乎一下子都飛到九霄雲外了。
陶侃急忙扶起庾亮，說道：“庾将軍言重了。國家有難，不隻是你一人之過啊。”
庾亮含淚說道：“元規對不起先帝和太後，對不起皇帝，也對不起衆位大臣和百姓啊。”
陶侃見庾亮果然風流儒雅，氣度不凡，頓生好感，但是嘴裏卻還是不依不饒地對庾亮帶有諷刺意味地說：“君侯修石頭（即修建康城）以防我，今日爲何卻反過來求我呢？”
庾亮說：“以往确實是我元規沒有識人之慧眼，做事不當，所以導緻今日朝廷被動，朝局動蕩不安，萬千之錯，都是我一人知錯，請陶将軍責罰便是。”
陶侃哈哈大笑：“君侯太過自責了。大敵當前，咱們必須共同對敵，就不信他蘇峻和祖約能夠翻天！”
這時溫峤急忙插話：“今日咱們幾路大軍會合一處，自當同心協力，争取早日取得平叛勝利。今天，我溫太真略備薄酒，爲咱們聯軍盟主接風洗塵。”
于是溫峤設宴招待。幾個主将談宴終日，庾亮、陶侃之間的隔閡逐漸消除，氣氛開始趨于融洽。
庾亮在吃荞頭的時候，根須都放在一邊，沒有丢棄。
陶侃問道：“你留這個有什麽用呢？”
庾亮回答說：“這個還可以種啊。”
陶侃聞聽贊歎良久，說：“沒想到，庾元規不僅僅風流蘊藉，儒雅潇灑，而且确實具有從政的素質啊。”更加欣賞庾亮。
讨伐軍于是齊心要進攻建康，平滅蘇峻，這便形成了“西軍”。不久便起兵。
同時王導以太後密令要三吳吏士起義兵援救建康。會稽内史王舒于是命早前逃亡到當地的庾冰擔任奮武将軍，領兵渡過浙江，吳興太守虞潭、吳國内史蔡谟和前義興太守顧衆都舉兵響應。至此三吳的“東軍”也起兵了。
蘇峻知道陶侃領導的西軍起兵後，非常吃驚，他不得不心悅誠服地說：“我早就估計到溫峤很能得人心啊！”
蘇峻聽從參軍賈甯的計謀，由姑孰退守石頭，分兵對抗西軍各部。而派管商、張健和弘徽等對抗東軍。與虞潭互有勝負，相持不下。
這時蘇峻也逼迫成帝遷到石頭城。成帝之母、庾亮的妹妹庾太後不堪忍受蘇峻将士的侮辱，自殺身亡。
毛寶受命率領一千人作溫峤的前鋒，駐紮在茄子浦。正好遇見了一樁“大買賣”。原來毛寶派出去的探子回來報告說：“蘇峻送給祖約軍隊一些糧食，祖約的司馬桓撫接受了這些糧米，正在向這裏走來，看來茄子浦是他們運糧隊伍的必經之地。”
毛寶一聽非常高興：“這送到嘴邊的肥肉，不吃白不吃啊，他們有多少人啊？”
探子說：“看來人不少，大約一萬多人吧。”
毛寶作難了——是啊，人數懸殊太大，一千對一萬，太冒險，如果己方的人數再多點兒，感覺就保險一些……
沒想到，正打瞌睡呢有人就送來了枕頭，需要人手呢，還真來了很多幫手——郗鑒随後率衆渡江也來到了茄子浦，正是來與溫峤軍隊會合的。
這時候士兵們仍有顧慮，因爲要想去劫糧，就必須上岸去打伏擊戰，但是士兵們卻都不敢随便上岸。這是因爲當初，溫峤認爲南軍熟悉水戰，蘇峻軍善于步戰，想用己之長制彼之短，就宣令三軍：“有上岸者處死。”
于是毛寶就對部下說：“兵法上說：軍令有所不從。現在情況變了，哪能不上岸呢！如果溫将軍要拿軍令處罰大家的話，就由毛寶我自己承擔罪責好了！”
這樣就打消了兵士們的顧慮，采用變通之辦法率領兵士打了個漂亮的伏擊戰，成功襲擊了祖約的司馬桓撫，奪取全部米糧一萬斛米，并俘虜斬殺一萬多名賊軍，令祖約更加缺糧，祖約軍隊因此大饑。
溫峤得知這一喜訊，十分高興。他嘉獎了毛寶的功勳，上表任命他爲廬江太守。
之後溫峤就與陶侃以水軍直指石頭城。
蘇峻當時見到在查浦的陶侃軍和沙門浦的溫峤軍兵士衆多，顯得有些畏懼。
但另一方面，在廣德的桓彜顯得孤立無援，周邊郡縣都向蘇峻投降，但桓彜堅決不降，後被韓晃擊敗并圍困，最終因城陷桓彜被殺。
東軍方面，蘇峻開始打算以赦免庾亮諸弟以取悅衆心，但仍派張健、管商、弘徽等人進攻。起初東軍雖有小勝，管商等進攻吳郡，焚燒了吳縣、海鹽、嘉興，打敗了諸路義軍。
管商等又焚燒餘杭，也焚毀了剛建成的靈隐塔寺。但在武康被官軍打得大敗，退守義興。
但後來庾冰與顧飏皆被張健擊敗，令吳郡郡城被張健所掠。顧衆與虞潭後也被管商擊敗，分守吳興及柴辟。後虞潭再于吳興戰敗，吳興郡的東遷、餘杭和武康都因其軍敗退而被蘇峻軍搶掠。虞潭派往吳縣的督護沈伊亦敗于管商。抵抗形勢很不樂觀。
西路讨伐軍逼近石頭城時就打算作一次決定性戰役，但陶侃認爲蘇峻兵強難以争鋒，打算進行持久戰并以智謀擊敗他。後因多次交戰都無大成果，便築白石壘固守，由庾亮領二千守軍據守。不久蘇峻以萬人來攻，庾亮帶領将士死打硬拼，頑強抵抗，蘇峻仗着人多也不能攻破。陶侃于是命郗鑒和郭默還駐京口，建大業、曲阿和庱亭三壘分散蘇峻軍力。
祖約發現桓宣帶領部下悄悄脫離了自己，便派遣祖渙和桓撫追擊，追到馬頭山。同時祖約也讓祖煥、桓撫他們襲擊湓口的陶侃，而馬頭山在去往湓口的途中。
陶侃要親自迎戰，毛寶說：“義軍都依賴陶公，殺雞焉用宰牛刀？陶公不可輕動，就讓我帶兵去征讨如何呢？”
陶侃禁不住對毛寶另眼相看。他對座中賓客誇贊說：“這個年輕人不簡單啊，他的話可以采用。”于是就派毛寶去了。
此時，桓宣被祖渙、桓撫等人攻擊，便派人下山向毛寶求救。毛寶手下人認爲桓宣本來就是祖約的人，懷疑他。于是桓宣派他的兒子桓戎再來求救，毛寶就跟着桓戎去救援。毛寶率兵趕到，賊軍與桓宣激戰正酣。桓宣已經明顯招架不住了。
毛寶軍遠離後方兵力薄弱，軍械質量低劣，但毛寶勇猛上陣，率領将士拼死一戰，終于趕跑了賊軍，解救了桓宣。毛寶所帶軍士傷亡大半，毛寶自己也中了一箭，箭穿過大腿釘入馬鞍，讓人踏着馬鞍才把箭拔了出來，血流滿靴。
毛寶領兵救援并成功擊敗對手，使得桓宣解困并投歸溫峤。此後毛寶又于東關與祖約作戰，攻破了合肥城。
令祖約沒想到的是，他的下屬将領竟暗中勾結後趙，作爲内應。
後趙于是派石聰和石堪渡過淮河進攻祖約守衛的壽春。裏應外合之下，祖約被後趙軍擊敗，逃奔曆陽，而後趙軍則俘虜脅迫着壽春二萬多戶人北歸。
蘇峻的心腹路永、匡術和賈甯知道祖約兵敗後都感到害怕，于是勸蘇峻盡誅大臣，改立自己的心腹爲朝廷大員。但蘇峻敬重王導，不肯接受。路永等因而對蘇峻不滿。
王導一看叛軍裏邊起了内讧，感覺有機可乘，便派參軍袁耽勸說路永歸順。王導及後試圖靠着路永救出成帝投奔義軍，但因守備森嚴而失敗，王導于是帶二子與路永逃到白石。
讨伐軍與蘇峻軍相持不下，而蘇峻分遣諸将四出攻掠，擒獲很多，軍威日漸強盛，戰無不克，因此陶侃、溫峤的義軍士氣低落，部衆多懷有異心。
朝中大臣很多趕來投奔來義軍的，相互轉告說：“蘇峻狡猾奸詐智謀多，他的将士也很骁勇，所向無敵。應當以天子的名義讨伐罪人，要想誅滅他恐怕要用一個時期；若是憑義軍的抵抗，不易剿除。”
溫峤聽了這話，十分惱怒，說道：“你們都是膽小鬼，這是長賊人的志氣，滅義軍的威風啊！”
但此後溫峤始終無法擊潰蘇峻軍，反倒軍糧用盡。别無他法，溫峤隻好提出向陶侃借糧。
此舉卻令陶侃十分不滿。他說：“我早就說過，對付這些叛軍不是短期内能成功的，現在咱們接連吃敗仗，你的軍糧也用完了。我看就算了吧，打不赢，暫時可以休戰。我要退回荊州慢慢跟叛軍打消耗戰了。”
溫峤一看陶侃氣餒了，又不想借給他軍糧。便說：“漢光武帝在昆陽之戰和曹操于官渡之戰中不是都以寡敵衆，先敗後勝的嗎？原因很簡單，這都是因義而勝。現在蘇峻因小勝必定驕傲，咱們正好可以利用他這一心理，打他個冷不防，一次挑戰就可一鼓而擒之。”
陶侃聽了猶豫不決。
毛寶一看這陶侃想就這樣率衆退回去，便對溫峤說：“下官能留住他。”
然後毛寶就去對陶侃說：“此仗打到現在，可以說是中途，也可以說是功虧一篑。如今猶如騎虎，不能中途下來，若陶将軍違反了衆意返回荊州，咱們的聯軍必定會失望喪氣，其結果那肯定是要兵敗，那最後的不義之名就會落在陶将軍一人身上啊。賊人也怕死，不是每個人都勇敢，陶公可以試着給我一些部隊，讓我上岸去切斷賊軍的物資糧草，出其不意，使賊軍困頓。如果我不能成功，然後将軍再走，人們心中就沒有遺憾了。”
陶侃聽了聽，感覺在理。便提升毛寶爲督護，并說：“我可就看你的了，如果你不能切斷賊軍糧草，我還是會帶兵退到荊州的。”