陶侃同意了毛寶的建議，便給溫峤軍隊補充了軍糧。

然後毛寶果真順利地帶兵燒毀了蘇峻在句容、湖孰積囤的軍資、米糧，造成了蘇峻軍隊缺乏糧食和軍需物資的局面，也解除了陶侃退兵、讨伐軍分裂的危機。

不久，蘇峻派韓晃和張健攻打郭默守的大業壘。當時大業壘在圍困之下十分缺水，人都被逼飲用糞水。面對如此困境，作爲主将的郭默因爲畏懼而偷偷出走，隻留下兵士守衛。

在京口的郗鑒軍聽說作爲京口屏障的大業壘被攻打都很驚慌，紛紛要求後退到廣陵。郗鑒堅決不同意這個意見。他說：“我們這兩道防線直接關系到京師讨伐軍的安危，大業壘即便被攻破，還有我們京口這個屏障呢，所以我們一定要堅守。”

陶侃見大業壘情況危機，打算營救大業壘，但陶侃的長史殷羨說：“咱們的水軍不孰悉步戰，一旦營救失敗就會令讨伐軍陷于劣勢，不如我們來個圍魏救趙，直接攻擊石頭城，讓韓晃等自動退還以援救石頭城。”

陶侃說道：“此計甚妙！”便率水軍向石頭進攻，

328年（鹹和三年）九月，溫峤在白石修建行廟，大設壇場，祭告皇天後土、祖宗之靈，溫峤親自宣讀祝文，宣布向蘇峻叛軍進行最後的決戰。他語氣激昂，淚流滿面，三軍将士都不敢擡頭觀看。

召開了誓師大會，庾亮、溫峤、趙胤等率步兵萬人從白石南下出戰，進逼蘇峻主力。蘇峻與匡孝率領八千人進擊，蘇峻令兒子蘇碩和蘇孝帶數十名騎兵迫近趙胤，打敗了趙胤軍。

蘇峻看見趙胤敗走，便說：“蘇孝能攻破賊兵，我還不如兒子蘇孝嗎？”便離開部衆，帶領數名騎兵北上突入敵陣，但沒有成功。蘇峻準備回奔白木坡，但座下戰馬突然原地打轉，不肯前行。見此情景，溫峤的牙門将軍彭世、李千等紛紛用長矛向蘇峻投擲。蘇峻從馬上墜落而死。讨伐軍兵士一擁而上，将蘇峻的屍體斬首分割，并點燃焚燒了屍骨。

蘇峻死後讨伐軍軍心大振，而蘇峻軍喪失鬥志，紛紛潰散。任讓于是立蘇逸爲主，閉城自守。管商和弘徽攻打庱亭壘，但被擊敗，管商于是向庾亮投降。

趙胤在另一方面派甘苗攻擊在曆陽的祖約，祖約于是乘夜帶左右數百人北逃到後趙，石勒雖然收留了他們，但是也等于是把他們軟禁起來了。

溫峤在蘇峻死後設立行台，命令全國二千石以下故吏到行台集合。然後召開動員大會，号召各地行動起來，剿滅叛軍殘餘。随後讨伐軍向叛軍展開反攻。

（329年）正月，陸晔和尚書左仆射陸玩遊說匡術以苑城歸附，匡術答應，陶侃于是命毛寶和鄧嶽守城。

叛軍派韓晃來進攻。毛寶登上城牆射死叛軍幾十人。

韓晃沖着城牆上向毛寶喊道：“莫非你就是毛廬江嗎？”

毛寶說：“正是。”

韓晃說：“哈哈，你以勇猛無敵聞名，何不出城跟在下決鬥呢？”

毛寶說：“你如果當真是員猛将的話，就請進城來吧，末将陪你玩玩！”

韓晃笑着退走了。

右衛将軍劉超和侍中鍾雅與建康令管佩等密謀帶晉成帝投奔西軍，但計謀敗露。蘇逸于是派任讓領兵入宮收捕劉超和鍾雅。此時成帝抱着二人不放，哭着說：“不得傷害我的侍中、右衛！”但任讓還是帶走并殺害了這二人。

329年二月，官軍向石頭城進攻，大敗蘇逸軍隊。溫峤臨陣斬殺蘇碩，晉西軍又擊殺蘇逸，晉成帝乘機逃出宮城，投奔溫峤。

成帝脫險後來到溫峤船中。群臣見到皇帝，無不下跪痛哭流涕。庾亮也屈膝下拜，以額伏地，泣不成聲。

第二天，庾亮晉見皇帝，又頓首至地，并請求辭官回家。帝不允許，派遣尚書侍中持手诏安慰庾亮：“這是社稷之災，國家之難，并非舅舅的過錯。”随後殺叛臣西陽王司馬漾并其二子及彭城王司馬雄。

任讓原來跟王導關系不錯，王導建議寬恕任讓。成帝說：“就是先前殺我右衛劉超和侍中鍾雅的那個小子嗎？絕對不能饒恕！”于是當即将他處死。叛軍将領張健、韓晃、馬雄等人也被郗鑒軍誅殺。至此，蘇峻、祖約叛亂全部平定。

公元329年（鹹和四年），蘇峻之亂平息後，宮廷宗廟都被焚爲灰燼。溫峤建議遷都到豫章（南昌），東吳之地的豪傑們請求定都于會稽（紹興），這兩種意見争來争去，誰也說服不了誰，朝廷不知怎麽辦爲好。

後來，還是由王導最後一錘定音。王導說：“建康，即古時的金陵，過去就是帝王之都，而孫仲謀、劉玄德都說這裏是帝王之宅。古代帝王不必因簡陋豪華而移都，如果能弘揚衛文公以大布之衣、大帛之冠爲君的風尚，則可無事不成。若不勤勉耽于安樂，即使找到一塊樂土，也會變成廢墟。況且北方敵寇像遊魂一樣，窺伺我們的空隙，我們一旦有膽怯的表現，跑到南越之地，再想得到威望和實力，恐怕是難以辦到的。現在應該特别鎮靜，這樣民情便可自安了。”

由此溫峤等人的遷都計劃未能實施。

鹹和四年（329）三月，蘇峻、祖約之亂平定後，大賞群臣。陶侃因功大爲侍中、太尉、封長沙郡公；郗鑒爲侍中、司空、南昌縣公；溫峤爲骠騎将軍、開府議同三司，加散騎常侍、始安郡公；陸晔進爵江陵公；封毛寶爲州陵縣開國侯，食邑一千六百戶。其餘賜爵侯、伯、子、男者甚多。

卞壸、桓彜、劉超、鍾雅等死難者均加贈恤。陶侃移鎮巴陵（今湖北嶽陽），溫峤還鎮武昌（今湖北鄂城）。庾亮再與成帝相見，伏地謝罪，再三請求歸隐江湖。在得不到批準的情況下，請求去地方鎮守效力。于是出任豫州刺史，領宣城内史，鎮守蕪湖。與此同時，參與蘇峻叛亂的路永、匡術、賈甯等人因中途背叛蘇峻投降朝廷，赦免其罪不治。

王導還想獎賞決戰前投奔朝廷的路永、匡術等人，欲給他們加官。溫峤說：“他們是蘇峻集團叛亂的主犯之一，隻因爲他們最後投誠了，才饒他們不死。他們犯了如此大罪，沒有要了他們的狗命，已經夠便宜他們的了，哪裏還能再讓他們繼續擔任官職呢？”

在溫峤的堅決反對下，王導隻得做罷。

湘州刺史卞敦在蘇峻叛亂時期首鼠兩端，既不讨逆，也不主動供給讨伐軍所需糧草。此時受到朝廷冷落。不久便憂愧抑郁而亡。

靈隐寺始建于東晉鹹和元年（公元326年），至今已有約一千七百年的曆史，爲杭州最早的名刹，也是中國佛教禅宗十大古刹之一。地處杭州西湖以西靈隐山麓，背靠北高峰，面朝飛來峰，兩峰挾峙，林木聳秀，深山古寺，雲煙萬狀。

開山祖師爲西印度僧人慧理和尚，他在東晉鹹和初，由中原雲遊至武林（即今杭州），見有一峰而歎曰：“此乃中天竺國靈鹫山一小嶺，不知何代飛來？佛在世日，多爲仙靈所隐”，遂于峰前建寺，取名叫“靈隐寺”。

可惜靈隐寺剛建成不久，就發生了蘇峻叛亂，慧理修建的佛塔佛寺未能幸免，被焚之一炬。蘇峻之亂平息後。來此地雲遊的高僧佛圖澄，提議重建靈隐寺。都鄉侯、散騎常侍何充非常敬重佛法，所以很高興主持重新修造。

何充（292年－346年），字次道，廬江郡灊縣（今屬安徽霍山）人。晉朝重臣。官至中書監、骠騎将軍、錄尚書事，封都鄉侯。後來在晉康帝和晉穆帝時輔政。

何充風度氣韻儒雅，才學淵博，能寫文章，酒量也很好，尤其是喝酒時的風度氣質讓人折服。當時的名士、丹陽尹劉惔(dan)曾經說：“看到何次道飲酒，就令人想把家中珍釀全都拿給他。”

何充是王導妻子的姨甥，而何充妻子是庾文君之妹，因此何充與晉明帝、王導都友好，很早就擔任顯要官位。

一次何充去見王導，王導以塵拂指着坐床叫何充和他同坐，說：“這裏是你的坐位。”甚至王導修繕揚州官舍時也向何充說：“修造這裏的衙門，正是爲了你何次道啊。”可見王導與何充的友好和親近。

何充正直敢言。當初擔任王敦主簿時，聽到王敦在公衆場合自賣自誇、爲其兄長王含“護短”說道：“家兄在廬江做官的官聲、政績都一定很不錯，廬江人士上上下下沒有不稱贊的。”

但當時身爲廬江太守的王含在當地貪污，名聲很臭。

何充當即直言反駁：“我就是廬江人，所聽到的根本就不是這麽回事。”王敦聽後沉默不語。在場衆人既佩服何充的耿直和膽量，又深深地爲何充感到不安，但何充神情自若。因此何充被王敦貶爲東海王文學。太甯二年（324年）王敦之亂平定後，何充被朝廷任命爲中書侍郎。

何充喜歡佛典，熱衷于修造佛寺，任東陽、會稽地方官時，平時供養沙門超過一百人，花費過億，但卻對親友未加照料。他的親戚朋友有的非常貧窮，他也不管不顧。因而引來時人非議。

太甯三年（325年），晉成帝即位後，任命何充爲給事黃門侍郎。鹹和三年（328年），曆陽内史蘇峻領兵攻陷建康後，何充東奔三吳地區加入王舒、虞潭等人的讨伐軍抗擊蘇峻。次年，蘇峻之亂被平定，何充被封爲都鄉侯、散騎常侍。

平南軍司、散騎常侍、豐城子劉胤，從來就不信奉佛法，傲慢三寶(括佛寶、僧寶、法寶）他來到新建成的靈隐寺，對何充說：“聽說這次靈隐塔的修建還邀請了中原的得道高僧前來指導了，是真的嗎？”

何充說：“這事兒千真萬确。是得道高僧佛圖澄前來主持的開光儀式。他還就近去了附近幾個風景名勝之地主持修建了寺廟，比較有名的就有太湖佛圖寺、潛山太平寺、宿松忠節寺等等。”

劉胤說道：“都說中原的高僧佛圖澄佛學深厚，道行高深莫測，可是看看眼前的這座佛寺也沒什麽特别之處啊？哦，我早就聽說此塔屢放光明，總認爲這簡直是荒誕不經，所以我從來不信。除非讓我親眼看見，才能相信。”

劉胤話剛說完，佛塔上立即放射出五彩光芒，照耀佛寺。劉胤驚得毛發倒豎，肅然起敬，趕緊伏地叩頭，口稱“死罪！死罪！”從此劉胤信奉佛法，并在劉胤的資助下，在靈隐寺寺院的東邊，又立了一座小塔。

此後沒幾天，劉胤便接到朝廷诏令。聖旨說：“由于溫峤病故，令劉胤代替溫峤擔任平南将軍、都督江州諸軍事、領江州刺史、假節。即日赴任。”

“哈哈，升官了！當大官了！哈哈哈……”朝廷的任命把劉胤樂得屁颠屁颠的。

天知道這次劉胤的升遷是福是禍。

那溫峤又是怎麽突然之間就病故了呢？

原來，溫峤在蘇峻之亂平定後，拒絕了朝廷上下讓他留在朝中輔政的要求。溫峤認爲王導是先帝所任命的人選，于是要求返回江州。此時的京師方經戰亂，殘破不堪，物資缺乏，溫峤給自己家裏留下一些生活必需品，将全部家當都獻給了朝廷，然後返回武昌。

329年四月，溫峤路過牛渚矶，見水深不可測，聽很多人說這裏水下有很多怪物，溫峤也多次聽到過類似的傳說。

溫峤便命人點燃犀牛角下水去照看。看見水下燈火通明，水怪奇形怪狀，往來穿梭，形形色色，有乘馬車的也有穿紅衣服的。

不料溫峤到了武昌。當夜，溫峤夢到一個人憤怒地對他說“我和你幽明有别，各不相擾，爲什麽要來照我們呢？”

夢醒之後，溫峤發現自己渾身像散了架一樣，半邊身子和手腳都不聽使喚。口眼歪斜，說話嘴唇不停地打哆嗦，還一個勁地流口水。

家人急忙去請醫診治。醫生說：“這是中風的症狀。”于是給他開了一些藥。

但不幸的是，沒幾天，溫峤就去世了，終年四十二歲。

江州百姓聽到溫峤去世的消息，無不相對而泣。

晉成帝下诏追贈溫峤爲侍中、大将軍，谥号忠武。