花謝花開，緣去緣來。開創一代武家的源賴朝不曾想到，在自己百年之後，自己的繼任者是如此的不争氣，政權轉瞬間被他人竊取，而他更想不到的是，這“竊國大盜”竟會是自己曾經無比信任的老丈人。或許，這就是曆史本身的冷酷和無奈。讓人不禁哀歎，在爾虞我詐的輪回中，似乎不存在永遠的朋友，而隻有永遠的利益。

爲了維系和鞏固鐮倉幕府的統治，在幕府統治發生動搖的最危難時刻，源賴朝之妻北條政子與父親北條時政重新制定了由13名幕府元老共同裁決的集體合議制度，使動蕩不安的幕府暫時得到了穩定。但是在安定政局的同時，幕府的實權卻也落到了北條氏的手中。

北條時政原是伊豆國土豪，人稱北條四郎。在源賴朝起兵時，他作爲源賴朝的得力部将參與天下的平定，後将女兒政子嫁與源賴朝，獲得他的極度信任。鐮倉幕府建立後任京都守護。

1203年8月，北條時政廢黜了源賴家，立源實朝爲幕府将軍，北條時政擔任執權。不久，北條時政殺害了源賴家，又欲廢黜源實朝，被其女兒政子阻止。迫于壓力，他引退于伊豆，其子北條義時繼任執權之職。爲了擴大自己的權力，北條義時殺死了侍所别當和田義盛，正式确立了北條氏的霸權。

1219年正月，北條義時暗殺了源實朝，鐮倉幕府的開創者源賴朝的正統血脈至此完全斷絕，北條氏掌握了幕府的最高權力。源氏血脈的斷絕使專權的北條義時面臨将軍無人繼任的問題，爲了穩固自己篡奪的地位，北條義時希望在皇族中挑選一人繼任“征夷大将軍”之位。但是以後鳥羽上皇爲首的院廳拒絕了北條義時的要求，于是北條義時率千騎人馬入京，要求自己選定的皇族将軍東下，院廳再次拒絕了他的請求。北條義時隻得改迎與源氏有血源關系的2歲的藤原賴經爲将軍。

雖然鐮倉幕府依然有将軍之名，但此時的“将軍”已經成了虛職，北條義時以“執權”的名義牢牢把控着鐮倉幕府的實權，并世代承襲“執權”之職。在幕府将軍繼任問題上的沖突，導緻幕府與皇室的對立更爲激烈。勵精圖治、力圖重新挽回皇族權力的後鳥羽上皇通過恩賜土地的方式收買和拉攏了對北條氏不滿的禦家人，不斷壯大自己的勢力，他于1221年5月集合了北面、西面武士，并向各地武士發布了讨伐北條氏的院宣，正式舉兵讨伐北條氏及其控制下的鐮倉幕府。這年爲承久三年，故而稱爲“承久之亂”。

後鳥羽上皇雖然發布了讨伐北條氏的院宣，但是應者寥寥，而人稱“尼姑将軍”的北條政子則集合禦家人，頌揚源賴朝給武士們帶來的安定富足的生活，也講述了在源賴朝之前武士們悲慘低賤的生活。

在北條政子的鼓動下，禦家人重新集結在幕府旗下。1221年6月15日，在北條義時之子北條泰時、其弟北條時房的率領下，從鐮倉出發，兵分三路挺向京都，不到一月，便以絕對優勢的兵力打敗了皇室軍隊，結束了“承久之亂”。

攻陷京都之後，北條氏将包括後鳥羽上皇在内的三位上皇流放孤島，并處死處罰了參與讨幕的貴族與武士，沒收這些人的領地達3000餘處，将其劃撥爲幕府的直轄領地，作爲恩賞賜給有功之臣，稱爲“新補低頭”。爲了能監控皇室的一舉一動，北條義時将原京都的六波羅館改爲六波羅府，任命北條泰時爲六波羅探題，其權力僅次于執權。

“承久之亂”之後，皇室喪失了軍權，皇位也由幕府一手操控，由此幕府逐漸取代皇室站到了國家權力的中心位置。

1224年，北條義時去世，北條泰時任幕府執權。北條泰時是一個頗有作爲的人，在他繼任執權不久，便實行了一系列的改革。1125年，爲了改變執權一人獨斷的體制，北條泰時設置了輔助政務的“聯署”一職，由其親信族人擔任。同時，爲了平衡權力，北條泰時還設立了最高決策機構“評定衆”，由11名精通政務的禦家人組成，與執權、聯署協商決定有關行政和司法的重大事務。

北條泰時在位期間，還制定了武家的基本法典《禦成敗式目》，因其在貞永元年（1232）制定，又被稱爲《貞永式目》。《禦成敗式目》共有51條條文，以通俗易懂的語言規定了守護、地頭的職分，以及禦家人土地所有權和繼承權的具體處置辦法。這是日本第一部專門針對武士階層制定的法典，是武家的基本法度，對後世許多武家的法典，産生了深遠的影響。

北條泰時之孫北條時賴擔任“執權”後，繼續其祖父的改革，1249年，爲了進一步完善以執權爲中心的政治體制，北條時賴設置了“引付衆”之職。“引付衆”的職責是協助審理文書及司法裁判。爲了加強北條氏的統治，北條時賴還廢除了名義上的将軍之位，并抑制北條氏旁支的勢力，将所有權力集中在北條嫡系家族——“得宗”手中，被稱作“得宗專制”的嫡長子繼承制由此建立。